assessing the exceptionality of coloured motifs in networks评估彩色图案在网络的除外.pdfVIP

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2017-09-11 发布于上海
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assessing the exceptionality of coloured motifs in networks评估彩色图案在网络的除外

Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2009, Article ID 616234, 9 pages doi:10.1155/2009/616234 Research Article Assessing the Exceptionality of Coloured Motifs in Networks Sophie Schbath,1 Vincent Lacroix,2 and Marie-France Sagot3, 4, 5 1 Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR1077, Unite Mathematique, Informatique et Genome, ´ ´ ´ 78352 Jouy-en-Josas, France 2 Centre for Genomic Regulation (CRG), Genome Bioinformatics Group, Universitat Pompeu Fabra, Dr. Aiguader 88, 08003 Barcelona, Spain 3 Universite de Lyon, 69000 Lyon, France ´ 4 ´ Laboratoire de Biometrie et Biologie Evolutive, Universite Claude Bernard Lyon 1, CNRS/UMR 5558, ´ ´ 69622 Villeurbanne, France 5 Projet BAMBOO, Institut National de Recherche Informatique et en Automatique (INRIA) Rhone-Alpes, ˆ 655 avenue de l’Europe, 38330 Montbonnot Saint-Martin, France Correspondence should be addressed to Sophie Schbath, sophie.schbath@jouy.inra.fr Received 1 June 2008; Revised 29 August 2008; Accepted 11 October 2008 Recommended by Dirk Repsilber Various methods have been recently employed to characterise the structure of biological networks. In particular, the concept of network motif and the related one of coloured motif have proven useful to model the notion of a functional/evolutionary building block. However, al