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- 2017-09-24 发布于湖北
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人类基因组单体型图细胞株中与遗传和基因表达变化有关的DNA甲基化模型
摘要
背景:DNA甲基化是参与基因调控和疾病的一种重要表观遗传学机制, 但很少人知道在个体间甲基化机制存在差异。 在这,我们从77个图约鲁巴人的人类基因组单体中测量了22,290 CpG二核苷酸的淋巴母细胞系的甲基化水平,同时也使用了全基因组的基因表达和基因型数据。
结果:通过对超过三百万常见的单核苷酸多态性(SNP)位点的甲基化水平关联的分析,我们确定在173个基因的180个CpG双核苷酸位点与附近的单核苷酸多态性(独联体通常在5 KB内)的错误发现率为10%。 在迪斯科相互作用蛋白2的同源基因B(DIP2B,以前推测在DNA甲基化中发挥作用)中发现SNP r最有趣的传输信号,全基因范围内的信号与第一组分的甲基化模式是有联系的。而且我们发现在整体信号联系中只有少量的反式作用。 正如预期的那样,通过测量的RNA序列,我们发现基因的启动子甲基化和基因表达水平呈 负相关关系。最后,发现有一个显着的SNP位点重叠,均与甲基化与基因的表达水平有关。
结论:我们的研究结果显示在个体间的差异在DNA甲基化方面有很强的遗传成分。 此外,丰富的单核苷酸多态性会影响甲基化和基因表达,为共享机制的一小部分的基因提供了证据。
背景:DNA甲基化在真核生物的基因组起着重要的调节作用。 甲基化的改变可以影响转录和
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