拓扑异构酶I和拓扑异构酶II。.pptVIP

原核生物和真核生物细胞内都存在可以除去超螺旋的拓扑异构酶I和拓扑异构酶II。另外，原核生物中还拥有一种特异的拓扑异构酶II，通称为促旋酶(gyrase)，它可以利用ATP水解提供的能量向DNA分子引入负超螺旋。拓扑异构酶I和拓扑异构酶II的作用与促旋酶相反，能够消除DNA分子上过多的负超螺旋。大肠杆菌的染色体DNA的超螺旋被维持在一个稳定的水平。 三、嵌入剂 溴化乙锭（ethidium bromide）是一种带正电的多环芳香族化合物。平面状的溴化乙啶能嵌入到碱基对平面之间。在紫外光下，溴化乙锭会发荧光，嵌入DNA后荧光强度显著增强。因此，溴化乙啶通常用来作为染料检测DNA的存在。 溴化乙锭的插入会增加相邻碱基对之间的距离，扭曲磷酸核糖骨架，降低螺旋程度。 目前仍然不清楚Z型DNA究竟具有何种生物学功能。但实验证明，天然B型DNA的局部区域可以出现Z型DNA的结构，说明B型DNA与Z型DNA之间是可以互相转变的，并处于某种平衡状态，一旦破坏这种平衡，基因表达可能失控，所以推测Z型DNA可能和基因表达的调控有关。 H-DNA是一种三股螺旋。能够形成三股螺旋的DNA序列呈镜像对称，并且一条链为多聚嘌呤链，另一条链为多聚嘧啶链，例如(CT/AG)n。H-DNA的三股螺旋中的一条链为多聚嘌呤核苷酸，它与一条多聚嘧啶核苷酸链形成双螺旋，另一条多聚嘧啶链与多聚嘌呤核苷酸同向平衡，嵌入到双螺旋的大沟之中。第三股链的碱基与标准碱基对的嘌呤碱形成Hoogsteen配对。 3. H-DNA AATTCAAGGGAGAAGTATAGAAGAGGGAAGGATC TTAAGTTCCCTCT TCATATCT TCTCCCTTCCTAG 在形成三股螺旋时，会有一条多聚嘌呤核苷酸被置换出来，保持单链状态。另外，在形成CGC三碱基对时，胞嘧啶和鸟嘌呤的Hoogsteen配对要求胞嘧啶的N3质子化，因此三股螺旋易于在酸性条件下形成。负超螺旋也有利于H-DNA的形成。 尽管三股螺旋的形成受到的限制比双螺旋多，然而计算机搜索发现在天然的DNA分子中能够形成H-DNA的潜在序列比预期的要多，并且不是随机分布。例如 (CT/AG)n出现在许多基因的启动子、重组热点和复制起点中。如果删除启动子中的(CT/AG)n，或者使其发生突变都会降低基因的表达，说明具有某种生物学功能。 一、超螺旋DNA 许多病毒DNA以及所有的细菌DNA都是环状分子。环状DNA也出现在真核生物的线粒体和叶绿体中。闭合环状DNA分子没有自由的末端。 第二节 DNA 超螺旋（DNA Supercoil） 从细胞中分离出来的环状DNA分子，例如SV40的环形DNA分子，如果在DNA链上没有断裂，呈超螺旋结构。超螺旋DNA是DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。超螺旋是有方向的，左旋的超螺旋称为正超螺旋，右旋的超螺旋称为负超螺旋。 为了说明超螺旋的方向，以一段由250碱基对组成的线形B型DNA为例来加以讨论。这段DNA的螺旋数应为25（250/10=25）。当将此线形DNA连接成环形时，此环形DNA称为松弛型DNA（relaxed DNA）。但是若将线形DNA的螺旋先拧松两周再连接成环形，这时闭合环形DNA两条链的互相缠绕次数比所预期的B型结构螺旋数要少,或者说是螺旋不足(underwinding) 。 这就造成这段DNA偏离最稳定的DNA结构，因此这种DNA产生了热力学紧张状态。这种结构扭力能够以两种方式被容纳：一种称解链环形DNA（unwound circle DNA），它的螺旋数为23，还含有一个解链后形成的环。另一种环形DNA称为超螺旋DNA（superhelix DNA），它的螺旋数仍为25，但同时具有两个超螺旋周，可使螺旋不足的DNA中的相邻碱基对以最接近于B型结构的距离堆积。并使分开的碱基通过氢键重新形成配对形式。由于欠旋引起的超螺旋是右旋的，为负超螺旋。 但是，如果把上述线型DNA分子的一端沿着双螺旋的方向拧紧两圈，再连接成环，则会形成两个正超螺旋。 当DNA是一个闭合环形分子或DNA被蛋白质所固定，使两链不能自由旋转时才能保持螺旋不足状态，如果在闭合环形DNA的一条链上有一个切口，切点上的DNA链自由旋转，就可使DNA分子由超螺旋状态恢复成松弛状态。一个DNA分子的螺旋状态可以用扭转数、缠绕数和连环数来精确描述。 扭转数是指DNA分子的双螺旋的数目；而缠绕数是指DNA分子中超螺旋的个数。扭转数和缠绕数之和就是链环数。 Lk＝Tw＋Wr 在共价闭合环状DNA分子（covalently closed circular DNA，cccDNA）中，扭转数和缠绕数是可以相互转换的。在不破坏任何共价