生命信息学肿瘤研究的新策略.docVIP

生命信息学：肿瘤研究的新策略 曹培国 （中南大学湘雅三医院肿瘤科，湖南，长沙 410013） 文摘：每一个生物体内都存在多种多样的生命程序及执行该程序的精巧而复杂的生物信息网络，生命程序的时、空有序性是保障机体正常生长、发育、分化的基础。肿瘤的发生可能是某些特定的生命程序被扰乱的结果，癌症的最后治愈也许只有通过纠正被扰乱的生命程序来实现。 关键词：生命信息学 恶性肿瘤 Bioinformatics: a new strategy for cancer research Cao Peiguo（Dept. of Oncology, The Third Xiangya Hospital, Central-South Univ., Changsha, Hunan, 410013） Abstract：Every organism has many different life programs and bioinformatic network which is delicate and complex. The exacting order of life programs warranty the normal growth development and differentiation of every organism. Some disturbed life programs may be the pathogenesis of neoplasms. The finally eradication of cancer may be accomplished only by rehabilitating the disturbed life programs. Key words: Bioinformatics Neoplasm 每一个生物体内都存在一个庞大、精巧、复杂的生物信息网络，使各种分子、细胞、器官、系统能构成一个统一的整体，并有条不紊地进行各种生命活动。现代医学对这些生命信息知之甚少，研究得还远远不够。人类与恶性肿瘤的抗争己有上千年，尤其是近年来各国在恶性肿瘤的研究上投入了大量的人力、物力，当前治疗肿瘤的手段仍然是手术、放疗、化疗这“三大法宝”，可这些“法宝”并没有使恶性肿瘤的治愈率有大的改观，相反，近年恶性肿瘤发病率和死亡率逐年上升。因此，我们是否应该改变一下当前肿瘤研究的策略，从整体观出发，把肿瘤放在生物信息网络这样一个大环境下来研究呢？ 1．生物信息网络的物质基础 机体生物信息千差万别，多种多样，如遗传信息、激素信息、神经信息、免疫信息等等，其通讯路径可粗分为两类：即由DNA转录成mRNA再翻译成蛋白质的遗传信息传递系统，和由能接受信号的特定受体、受体后信号转导途径及其作用终端所组成的细胞信号转导系统。各系统间又相互联系和作用，形成复杂的网络，如遗传信息传递的结果是蛋白质的合成，这些蛋白质很多是特定的受体和酶，参与细胞信号转导过程，细胞信号转导的终端是DNA，调控特定基因的开启或关闭。 遗传信息：遗传的物质基础是DNA，人类全部DNA中估计有6－12万个基因，由约30亿个碱基对组成，携带了人类任何一个个体生、老、病、死的全部遗传信息。研究遗传信息的表达和调控是一个更高、更深层次的课题，任何一个基因的表达是一个在时空上有序的生物学过程，基因表达的时空有序性如果受到干扰和破坏，则可引起异常的生物学过程，即基因表达的时空有序性是调控的结果。在活细胞中，特定的细胞状态下不仅是某一种基因表达及其调控的结果，也是不同基因表达、协调过程的表现，因此，基因表达存在着多重调控和调控网络，许多生命现象的深层次问题都集结于此。 细胞信息与调控：组成生物体的基本单位是细胞，细胞间的通讯主要是通过信号转导实现的，常见的各种生物学现象如生长、发育、分化、神经反应等，无论通过何种机制，基本上都与信号转导密切相关。现已知道，外源性活性物质如生长因子、各种细胞因子、激素、神经递质等，作为细胞外信号，通常先经过跨膜传递机制将信号传递至细胞内，再通过第二信使系统、第三信使系统或别的系统传递至细胞核内，启动或关闭特定基因的表达。信号转导不仅与基因表达调控有关，也与蛋白质功能表现和调控有关，不仅与一系列正常生理过程有关，也与许多病理过程有关。细胞信号转导机制研究是目前分子生物学中方兴未艾的研究热点。 除细胞信号转导通路的研究外，目前开如重视“信息相互交谈”的研究。所谓“信息相互交谈”，即细胞外各种生物活性物质之间、细胞与细胞之间、受体与受体之间、细胞内信使之间、胞浆内信使与核内信使之间以及核