戚豫1遗传病的实验室检查手段超级简化版.pptVIP

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戚豫1遗传病的实验室检查手段超级简化版

母体血浆中的胚胎DNA Lo YM et al. Fetal cf-DNA detected via Y chromosome, Lancet 1997 胎儿游离DNA:cell-free fetal DNA(cff DNA) 母体外周血含有cffDNA,几乎全部来源于胎盘滋养细胞。 怀孕4周可检出,8周后含量上升并稳定存在。(7周建立胎儿胎盘循环)。 cffDNA片段比较小,长度在75bp和250bp之间。 母体外周血中的cffDNA含量在5%到30%之间。孕周越大外周血中胚胎DNA的含量越高。与母亲体重有关。 产后2hr之内消失。 * * 22条常染色体 23条常染色体 20% 胚胎 DNA 3 80% 2 胎儿 80% 母亲 染色体非整倍体导致剂量变化 * * 技术和科学的目标 that government of the people, by the people, for the people, shall not perish from the earth. ————by Abraham Lincoln * * 基因诊断的制高点——多基因病: 能否靠基因芯片或微阵列解决? Random array of clusters 100um * * * 划时代的新技术——大规模二代测序NGS(Next Generation Sequencing) 人类基因组计划长达10年、耗资千亿、6国数万科学家投入,仅完成4个人的基因 2007年:1人,3天内,3000美元,费用和时间在以每年递减一半的速度下降——取代所有一切,40种常见病发表。。。多基因病时代来了? SOLEXA_illumina 1G Genome Analyzer * * Instrument without Covers Fluidics electronics Flow cell detection Laser optics * * Flowcell in Imaging Location * * 基因诊断和产前基因诊断中的 知情同意和伦理学问题 实验室有认证、国家标准和质量控制 实验人员有许可证 有标准实验流程MOPS、质控/质评 签发临检报告要慎重、留余地 可靠性和及时性兼备 * 样品的采集与保存 对象 保存环境 保存期限 白细胞/皮肤细胞* 低温≤ ?20C° 1年 EBV转化淋巴细胞系* 冻存液氮 无限 组织 冰冻?80C° 3年 毛发(带毛囊) 低温≤ ?20C° 1年 口腔脱落细胞 低温≤ ?20C° 1年 DNA 高盐冷藏4C° 10年 RNA全血(抗冻剂) 低温?20/?80C° 1年/3年 蛋白粗提物 低温≤ ?70C° 半年 *白细胞可经EBV转化建立永生细胞株,皮肤成纤维细胞可培养永久保存无限扩增 * * 还有很重要的,样本库 * 完整有用的样本一定要有专业的数据库: 临床和背景资料齐全 有编号、易检索(条形码管理) 纳入合适的样本库 保存条件合格 无降解 无污染 数据库要素: 病人一般资料 临床特点 家族资料 样品管理 家系调查网络组 * 构成小型样本库的硬件和软件 每台立式冰箱:16~20个耐酸铝架;20个蜡纸or塑料盒/架;9×9冻存管/盒=25920~32400管标本(3.5ml) 条形码打印机 耐低温标签 扫码枪 * * 大型标本库的构成与核心 区域规划: 缓冲区 核心:库区 监控室 样本接收区 样本处理区 辅助功能区:用品库、办公室、更衣室 * * * 是多功能的大型实验室: 研究 教学 临床基因诊断 标本库 实验中心大楼位于北大医院门诊南侧,7 层, 面积7000m2 Central laboratory Research Teaching Clinical genetic diagnosis BioBank 简介:北京大学第一医院实验中心 (中心实验室) * * 临床基因扩增诊断实验室 Standard PCR Laboratory 300m2, strictly managed in CAP way Negative?pressure double systems 100,000

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