神威太湖之光并行程序设计与优化-国家超级计算无锡中心.PDF

神威 太湖之光 • 并行程序设计与优化 （第一版） Ver1.2 陈德训 刘鑫 编著 国家并行计算机工程技术研究中心 国家超级计算无锡中心 二〇一七年四月 “神威•太湖之光”计算机系统并行程序设计与优化 内容说明 “神威•太湖之光”计算机系统是世界上首台峰值运算速度超过十亿亿次量 级的超级计算机，也是中国第一台全部采用自主技术构建的世界第一的超级计算 机。为让高性能计算应用开发人员更好的在“神威•太湖之光”计算机系统上开 发出高效的并行应用软件，本书在整理 “神威•太湖之光”计算机系统相关手册 的基础上，增加了国家并行计算机工程技术研究中心多个研发团队多年来在 “申 威 26010”异构众核系统上的优化经验总结，这些团队包括：科学与工程计算研 发团队、基础语言编译研发团队、并行程序设计环境研发团队、MPI 与性能评测 研发团队等，在此表示感谢！ “神威•太湖之光”计算机系统部署在国家超级计算无锡中心，面向科学和 工程计算的各个领域，使用的处理器是 “申威26010”异构众核处理器，该处理 器采用了针对该处理器定制的申威指令系统，与 X86 指令系统不兼容。为了满足 部分超算用户使用与 X86 指令系统兼容的商用应用软件系统的需求，在系统研制 过程中增加了部分 X86 多核处理器作为辅助计算系统，但在 “神威•太湖之光” 计算机系统的主要指标中没有体现该部分资源。本书所介绍的大部分内容只涉及 “申威 26010”异构众核处理器部分，X86 多核处理器部分因为采用了标准的集 群系统架构，因此在本书中没有过多的述。 本书在第三章和第四章介绍了 “神威•太湖之光”加速线程库和 OpenACC 两 种主要的并行编程模型；第五章介绍了串行编程的优化方法；第六章介绍高性能 扩展数学库的使用方法；第七章介绍了超节点内与超节点间的通信优化措施；第 八章介绍了几种常用的性能测试工具；第九章介绍了两个实际应用软件的优化实 例，其中“航天飞行器跨流域数值模拟统一算法并行软件”由国家计算流体力学 实验室李志辉老师团队开发，国家并行计算机工程技术研究中心应用团队负责优 化，“全球大气浅水波方程显式求解软件”由中科院软件所杨超研究员和清华大 学薛巍、付昊桓等老师所带领的团队联合研发并优化，是 2016 年度“戈登•贝尔” 奖的预先研究课题。 “神威•太湖之光”计算机系统并行程序设计与优化 该书主要面向 “神威•太湖之光”计算机系统应用软件的开发和优化人员。 本书可作为参考书或手册使用。 由于时间仓促以及环境的复杂性，其中有些不足或错误之处敬请各位读者指 出并Email 到 adch@263.net 或 yyylx@263.net,我们将在下一个版本中加以更正， 在此先表示感谢！ 编者 2017 年 3 月 16 日 “神威•太湖之光”计算机系统并行程序设计与优化 目 录 第 1 章 系统简介 1 1.1 系统总体架构 1 1.2 “ 申威26010”异构众核处理器 2 1.2.1 主要技术指标 3 1.2.2