- 1、本文档共12页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析_巩檑
,
分子植物育 2015 年,第 13卷, 8期,第1745-1756页
种 第
MolecularPlantBreeding,2015,Vol.13,No.8,1745-1756
研究报告
ResearchReport
旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析
1 1 1 1 1 1 1* 2 3
巩檑 张丽 聂峰杰 陈虞超 甘晓燕 石磊 宋玉霞 郭志乾 王峰
1宁夏农林科学院农业生物技术研究中心,银川,750002;2 宁夏农林科学院固原分院, 固原,756000;3 宁夏农林科学院荒漠化治理研究所,银
川,750002
*通讯作者,songyx666@163.com
摘 要 目前关于马铃薯对干旱胁迫和水分刺激的分子调控机理尚不清楚,而从组学水平整体分析转录因
子的表达模式对于有效筛选关键调控基因、解析胁迫响应分子调控网络和促进分子育种具有重要意义。本研
究利用高通量测序技术对正常浇水(对照,CK)、模拟干旱胁迫(D)和旱后复水(RW)处理后宁薯4 号叶转录
因子表达谱进行分析。结果表明:测序数据经denovo拼接共获得 134 191条非冗余Unigenes,N50 长度
、注释后共检测到 、
1 942bp;与已公布的马铃薯基因组和转录组数据库比对 55个家族 1739个转录因子编
码基因;干旱处理组和复水处理组中分别检测到867和1026个差异表达转录因子编码基因;3个对比组中
。ERF、bHL 、WR 、C2H 、MYB和NAC 等是6类富集差
的差异表达基因均以上调表达方式为主 H Y 2 异表达
erentiallyexpressedgenes,DEGs) 、 s 化最显著的转录因子家族。数据分析显
基因(diff 数量最多 DEG 表达量变
bHL 、MYB、ER 和下调bZI 编码
示:复水组中偏向通过增加上调类型 H F P 因数量来实现叶片对水分刺激
的应答调节;而干旱组更偏向保持bHLH、bZIP和ERF上、下调DEGs数量平衡来实现叶片对干旱胁迫的响
应。从测序数据中选取了 10个转录因子编码基因,利用Real-timePCR方法验证测序数据的有效性,结果表
明干旱组和复水组测序结果的表达量(FPKM)与用荧光定量PCR 法得到的基因表达量之间的相关性分别
9 9 研究结果可为深入探讨马铃
为0.979 和0.985 ,结果证实了两种处理产生的差异表达基因数据的有效性。
薯对干旱胁迫的分子响应机制奠定了数据基础。
关键词 马铃薯,转录因 ,转录组,干旱,水分刺
子 激
Transcriptome Analysis on Transcription Factors of Potato (Solanum
tuberosum)underDroughtStressandRehydrationTreatment
Gong Lei 1 ZhangLi 1 Nie Fengjie 1 Chen Yuchao 1 Gan Xiaoyan 1 Shi Lei 1 Song Yuxia 1* Guo
Zhiqian2 WangFeng3
1AgriculturalBiotechnologyCentre,NingxiaAcademyofAgricultureandForestrySciences,Yinchuan,750002;2GuyuanInstituteofAgricultural
Sciences,NingxiaAcademyofAgricultu
您可能关注的文档
最近下载
- 电光PBG-()Y高压配电装置说明书(永磁DSB-600B型).pdf
- 中国血脂管理指南(基层版2024年).doc
- 一汽-大众供应商代码文档.pptx
- GB∕T 33580-2017 橡胶塑料挤出机能耗检测方法(高清版).pdf
- 双减背景下新课标单元整体作业分层设计案例 人教版小学数学四年级下册第八单元 数学广角优化.docx
- 标日【初级】单词.pdf VIP
- 初中英语新人教版七年级上册Unit 1 Hello练习题(附参考答案)(2024秋).doc
- 产品包装纸箱设计规范.doc
- 《大单元视域下小学语文中段习作单元教学的实践研究》课题研究方案.doc
- 管理学(第九版)-哈罗德·孔茨、海因茨·韦里克课后题答案.pdf VIP
文档评论(0)