旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析_巩檑.pdf

， 分子植物育 2015 年，第 13卷， 8期，第1745-1756页 种 第 MolecularPlantBreeding,2015,Vol.13,No.8,1745-1756 研究报告 ResearchReport 旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析 1 1 1 1 1 1 1* 2 3 巩檑 张丽 聂峰杰 陈虞超 甘晓燕 石磊 宋玉霞 郭志乾 王峰 1宁夏农林科学院农业生物技术研究中心,银川,750002;2 宁夏农林科学院固原分院, 固原,756000;3 宁夏农林科学院荒漠化治理研究所,银 川,750002 *通讯作者,songyx666@163.com 摘 要 目前关于马铃薯对干旱胁迫和水分刺激的分子调控机理尚不清楚，而从组学水平整体分析转录因 子的表达模式对于有效筛选关键调控基因、解析胁迫响应分子调控网络和促进分子育种具有重要意义。本研 究利用高通量测序技术对正常浇水(对照,CK)、模拟干旱胁迫(D)和旱后复水(RW)处理后宁薯4 号叶转录 因子表达谱进行分析。结果表明：测序数据经denovo拼接共获得 134 191条非冗余Unigenes，N50 长度 、注释后共检测到 、 1 942bp；与已公布的马铃薯基因组和转录组数据库比对 55个家族 1739个转录因子编 码基因；干旱处理组和复水处理组中分别检测到867和1026个差异表达转录因子编码基因；3个对比组中 。ERF、bHL 、WR 、C2H 、MYB和NAC 等是6类富集差 的差异表达基因均以上调表达方式为主 H Y 2 异表达 erentiallyexpressedgenes,DEGs) 、 s 化最显著的转录因子家族。数据分析显 基因(diff 数量最多 DEG 表达量变 bHL 、MYB、ER 和下调bZI 编码 示：复水组中偏向通过增加上调类型 H F P 因数量来实现叶片对水分刺激 的应答调节；而干旱组更偏向保持bHLH、bZIP和ERF上、下调DEGs数量平衡来实现叶片对干旱胁迫的响 应。从测序数据中选取了 10个转录因子编码基因，利用Real-timePCR方法验证测序数据的有效性，结果表 明干旱组和复水组测序结果的表达量(FPKM)与用荧光定量PCR 法得到的基因表达量之间的相关性分别 9 9 研究结果可为深入探讨马铃 为0.979 和0.985 ，结果证实了两种处理产生的差异表达基因数据的有效性。 薯对干旱胁迫的分子响应机制奠定了数据基础。 关键词 马铃薯,转录因 ,转录组,干旱,水分刺 子 激 Transcriptome Analysis on Transcription Factors of Potato (Solanum tuberosum)underDroughtStressandRehydrationTreatment Gong Lei 1 ZhangLi 1 Nie Fengjie 1 Chen Yuchao 1 Gan Xiaoyan 1 Shi Lei 1 Song Yuxia 1* Guo Zhiqian2 WangFeng3 1AgriculturalBiotechnologyCentre,NingxiaAcademyofAgricultureandForestrySciences,Yinchuan,750002;2GuyuanInstituteofAgricultural Sciences,NingxiaAcademyofAgricultu