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利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位.pdf
中国油料作物学报 2016,38(6):750 -756
ChineseJournalofOilCropSciences doi:
10.7505/j.issn.1007-9084.2016.06.007
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
周小静 ,董 洋 ,张 芳 ,任小平 ,陈玉宁 ,黄 莉 ,陈伟刚 ,廖伯寿 ,雷 永 ,晏立英 ,罗怀勇 ,姜慧芳1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1
(1.中国农业科学院油料作物研究所,农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,湖北武汉,430062;
2.全国农业技术推广服务中心,北京,100125 )
摘要:为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5 号和ICGV86699衍生
的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用WindowsQTLCar
tographerV.2.5 软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个 QTL。
各QTL解释的表型变异为3.98%~13.77%,LOD值介于2.59~7.36之间,其中6个为贡献率大于 10.0%的主效
QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b 在3个单
环境和联合环境中都能检测到,一致性QTLcqSPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人
的研究结果比较发现,cqSPA5b 与另外两个不同群体鉴定出的A5 染色体上出仁率 QTL 区间相似。本研究结果为
出仁率QTL 的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
关键词:花生;出仁率;QTL定位;SNP标记图谱;meta-QTL分析
中图分类号:S565.203 文献标识码:A 文章编号:1007-9084(2016)06-0750-07
QTLmappingofshellingpercentageusingSNP-basedhighdensitygeneticmapincultivatedpeanut
ZHOUXiao-jing1 ,DONGYang ,ZHANGFang ,RENXiao-ping ,CHENYu-ning ,HUANGLi ,1 2 1 1 1
CHENWei-gang1 ,LIAOBo-shou ,LEIYong ,YANLi-ying ,LUOHuai-yong ,JIANGHui-fang1 1 1 1 1
(1.OilCropsResearchInstituteoftheChineseAcademyofAgriculturalSciences,KeyLaboratoryof
BiologyandGeneticImprovementofOilCrops,MinistryofAgriculture,Wuhan430062,China;
2.NationalAgriculturalTechnicalExtensionandServiceCenter,Beijing 100125,China)
Abstract:Shellingpercentageisanimportantfactorinfluencingthepeanutyield.Inordertodissectthegenet
icbasisofshellingpercentage,aRILpopulationwasusedfromthecrossofZhonghua5andICGV86699,bothof
whichhavehighandlowshellingpercentagerespectively.BycombiningthephenotypicdatawiththefirstSNP-
basedhighdensitygeneticmapincultivatedpeanut,wei
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