高性能计算机群——“神马”目前情况介绍 刘晓娟 于治 等离子体所五室 .docVIP

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高性能计算机群——“神马”目前情况介绍 刘晓娟 于治 等离子体所五室

高性能计算机群 刘晓娟 于治 等离子体所 主要内容 简介 登录方式 主要目录 软件环境 作业队列 集群管理章程(草案) Part1:简介 神马集群由old神马集群和new神马集群构成。 old神马集群: 18个曙光T2600计算节点 hostname:shenma11shenma28 1个登录/IO节点 hostname:shenma new神马集群:10个曙光T3600计算节点 hostname:shenma1shenma10 61个曙光T4600计算节点 hostname:shenma101shenma161 2个登录节点 hostname:shenma162,shenma163 4个I/O节点: hostname:shenma164shenma167 Part1:简介 神马集群:1个管理节点 hostname:master 三套存储: old神马集群的5.4T的SATA硬盘 new神马集群的14.4T的luster并行文件存 储系统 old,new神马集群可以共享的HP NAS存 储,约137T Part2:登录方式 神马集群由两个登录口,对应不同的登录域名。 登陆口1: ssh your username@hpc.ipp.ac.cn,登陆后会自动随机分配到登陆节点shenma11或者shenma12 ,登陆后会自动随机分配到登陆节点shenma162或者shenma163 注: (1)所有的用户只有一个用户名和密码,只是登录时选择的端口不一样; (2)建议大家使用登录集群,一段时间后我们会停用老神马,对其进行升级。Part3:主要目录 注:(只针对老用户) (1)/project2下的个人文件夹请自己拷贝 (2)曾经用过new神马的用户,其数据都放在/home/home.1,请自己拷贝 Part4:软件环境 module avail: Part4:软件环境 module avail: 注: (1)编译器有GNU,Intel,pgi,lf95 (2)mpi库有impi,openmpi,mvapich, (3)每个mpi都用四种编译器编译安装 (4)如:调用pgi的openmpi,只需要: module load compiler/pgi/12.8 module load mpi/openmpi/1.6.3 Part5:作业队列 四个队列:(两个登录节点都可以看到) new神马集群上的串行Part5:作业队列 , old神马集群 new神马集群 137T的 HP NAS存储 5.4T的SATA硬盘 14.4T的luster存储 /scratch /scratch /home 、/pkg、/project hpc.ipp.ac.cn shenma.ipp.ac.cn 登录 登录

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