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第一讲上课路易斯结构式、共振论、等电子体、分子间作用力和氢键
例如,具有方向性和饱和性的氢键则是蛋白质高级结构(蜷曲、折叠等)构建的原因之一。水甚至还成团地以氢键缔合,聚集在一些生物高分子蜷曲、折叠后形成的亲水空腔内,这些缔合水微团不但影响着亲水空腔的形状,进而还影响着生物高分子的高级结构与功能,而且无疑地可容纳如某些离子或小分子等亲水物种。 氢键使蛋白质 形成a螺旋(图中小球为 氢原子,虚线为氢键) DNA双螺旋是由氢键使碱基 (A…T和C…G)配对形成的(图中N—H…O, N…H—N,O…H—N,N…H—N,N—H…O是氢键) 三、范德华半径 范德华半径是指以范德华力作用而相邻的原子半径。例如:碘分子之间因范德华力相互作用(I—I…I—I,其中的虚线表示范德华力)。 范德华半径是考察分子结构的一种重要参考数据。例如,当发现两原子的核间距明显小于范德华半径之和时,可以预言,这两个原子之间一定存在某种比范德华力更强的作用力,如存在氢键或其他分子间力,或者存在共价键或其他化学键。 利用范德华半径和共价半径的数据可以通过几何学计算分子的大小。 3.极限式对共振杂化体的贡献 共振是稳定因素。共振杂化体的能量低于任一参与共振 的极限式。但并不是所有的共振结构对描述共振杂化体 的贡献是等同的。 ①含完整八隅体的结构比在价电子层上少于8个电子的 结构更稳定,贡献更大; ② 各共振极限结构式中,共价键的数目越多,其能量越低。 ③ 电荷没有分离的共振极限结构式稳定。 ④ 电荷分布符合元素电负性预计的共振极限结构式更稳定。 练习:说明各共振式在下列共振杂化体结构中的贡献。 贡献: ABC 讨论:A共价键数目多,没有电荷分离;B违反电负性 规则 ;C不符合八隅体规则 2.6 等电子体 等电子体原理:具有相同的通式——AXm, 价电子总数相等的分子或离子具有相同的结构特征。 “相同的结构特征” 包括:电子结构、分子的立体结构,化学键的类型,但键角并不一定相等,除非键角为180?或90?等特定的角度。 例: CO2、CNS–、NO2+、N3– 具有相同的通式—AX2,价电子总数16, 具有相同的结构——直线型分子, 中心原子上没有孤对电子而取sp杂化轨道,形成直线形骨架,键角为180?,分子里有两套?34 p-p 大?键。 例:CO32–、NO3–、SO3等离子或分子 相同的通式——AX3 , 总价电子数24, 有相同的结构—平面三角形分子, 中心原子上没有孤对电子而取sp2杂化轨道形成分子的骨架,有一套?46p-p大?键。 例:SO2、O3、NO2–等离子或分子, AX2,18e, 中心原子取sp2杂化形式, 平面三角形, 中心原子上有1对孤对电子(处于分子平面上),分子 立体结构为V型(或角型、折线型),有一套符号为?34的p-p大?键。 在 BF 3 、CO 3 2- 、 BF 4 - 、 P O4 3-分子中,哪些分子属于等电子体? 2.7 分子间力 除化学键(共价键、离子键、金属键)外,分子与分子之间,某些较大分子的基团之间,或小分子与大分子内的基团之间,还存在着各种各样的作用力,总称分子间力。相对于化学键,分子间力是一类弱作用力。 化学键的键能数量级达102,甚至103kJ/mol,而分子间力的能量只达n~n·10kJ/mol的数量级,比化学键弱得多。相对于化学键,大多数分子间力又是短程作用力,只有当分子或基团(为简捷起见下面统称“分子”)距离很近时才显现出来。范德华力和氢键是两类最常见的分子间力,分别介绍如下。 一、范德华力 范德华力普遍地存在于固、液、气态任何微粒之间。 微粒相离稍远,就可忽略; 范德华力没有方向性和饱和性,不受微粒之间的方向与个数的限制。 范德华力可分解为三种不同来源的作用力: 色散力 诱导力 取向力。 1.色散力 所有单一原子或多个原子键合而成的分子、离子或者分子中的基团(统称分子)。相对于电子,分子中原子的位置相对固定,而分子中的电子却围绕整个分子快速运动着。 于是,分子的正电荷重心与负电荷重心时时刻刻不重合,产生瞬时偶极。分子相互靠拢时,它们的瞬时偶极矩之间会产生电性引力,这就是色散力。色散力不仅是所有分子都有的最普遍存在的范德华力,而且经常是范德华力的主要构成。 色散力没有方向,分子的瞬时偶极矩的矢量方向时刻在变动之中,瞬时偶极矩的大小也始终在变动之中,然而,可以想见,分子越大、分子内电子越多,分子刚性越差,分子里的电子云越松散,越容易变形,色散力就越大。衡量分子变形性的物理量叫做极化率(符号a)。 分子极化率越大,
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