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第4章 蛋白质及共价结构

第4章 蛋白质的共价结构 蛋白质还可按生物功能分类,如: 酶、 调节蛋白、 转运蛋白、 贮存蛋白、 结构蛋白、等。 纤维状蛋白质 简单有规律的线性结构、形状呈细棒或纤维状。结构作用。如胶原蛋白、弹性蛋白、角蛋白、丝蛋白等,不溶于稀盐溶液和水。 4.1.4 蛋白质功能的多样性 蛋白质的种类估计在1010 ~1012数量级。 由20种氨基酸组成的20肽,有2×1018种序列异构体。 蛋白质的生物功能: 1)催化---酶的作用。 2)调节---调节蛋白,如胰岛素(激素),调节遗传信息转录的控制因子。 3)转运---转运蛋白,如血红蛋白、血清清蛋白(将脂肪酸从脂肪组织转运到各器官)是通过血流转运物质的。 4)贮存---如卵清蛋白、乳中的酪蛋白、植物种子中的贮存蛋白等。 5)运动---引起肌肉收缩的肌动蛋白,引起细胞运动的肌动蛋白、肌球蛋白等。 肽平面 4.3.2.2? C-末端分析 肼解法 4.3.8 二硫桥位置的确定 对角线电泳 4.3.9 蛋白质测定举例(自学) 4.3.10 蛋白质序列数据库(自学) 蛋白质的共价结构章完 4.3.3 二硫桥的断裂 过甲酸氧化法和巯基化合物还原法。 4.3.4 氨基酸组成的分析 完全水解的氨基酸用氨基酸分析仪测定。 4.3.5 多肽链的部分裂解和肽段混合物的 分离纯化 最有效地Edman化学降解法一次只能连续降解几十个残基,因此须先将长的多肽链水解成较小的肽段。 4.3.5.1 酶裂解法 胰蛋白酶 糜蛋白酶 嗜热菌蛋白酶 胃蛋白酶 木瓜蛋白酶 葡萄球菌蛋白酶 水解的专一性不同 蛋白酶的不同水解位点 4.3.5.2 化学裂解法 溴化氰(cyanogen bromide)只断裂由甲硫氨酸残基的羧基参加形成的肽键。 用羟胺断裂:Asn—Gly之间的肽链、Asn—Leu及Asn—Ala键。 4.3.6 肽段氨基酸序列的测定 4.3.6.1 Edmen化学降解法 4.3.6.2 酶降解法 外肽酶:氨肽酶和羧肽酶 4.3.6.3 根据核苷酸序列的推定法 ①是用待测的蛋白质作抗原免疫动物,得相应抗体; ②用此抗体去沉淀此种蛋白质的多核糖体(polysome),因为在这种多核糖体上含有该蛋白质的模版mRNA和与其相连而未被释放的蛋白质多肽链; ③后者将与加入的抗体发生结合而使多核糖体沉淀。 ④从沉淀中分离出该mRNA,并将它转录成cDNA。 ⑤测出cDNA的核苷酸序列,从而推测出蛋白质的氨基酸序列。 4.3.7 肽段在多肽链中次序的决定 用胃蛋白酶水解蛋白成较小片段,将样品点在滤纸中央 * * 蛋白质(protein)是一类最重要的生物大分子,在生物体中占有特殊的地位,与核酸构成细胞内原生质的主要成分。而原生质是生命现象的物质基础。? 4.1 蛋白质通论 4.1.1 蛋白质的化学组成和分类? 化学组成: 碳 50% 氢 7% 氧 23% 氮 16% 硫 0-3% 其他 微量 ? 凯氏定氮法的基础: 蛋白质含量 = 蛋白氮 ×6.25 单纯蛋白质: 仅由氨基酸组成,如核糖核酸 酶,肌动蛋白。 缀合蛋白质: 除氨基酸外还其他化学成分作 为结构的一部分。称为 (辅基或配体) 蛋白质的分类: 单纯蛋白还可根据溶解性及其它物理性质进行分类。 缀合蛋白可根据辅基分类。 根据形状和溶解度可分为三大类: 1)纤维状蛋白质 2)球状蛋白质 3)膜蛋白 4.1.2 蛋白质的形状和大小 球状蛋白质:形状接近球形或椭圆球形,多肽链折叠紧密,疏水的氨基酸侧链位于内部,亲水的在外部,如酶类。 膜蛋白:与细胞的各种膜系统结合而存在,为能与膜内的非极性相相互作用,膜蛋白的疏水氨基酸侧链伸向外部。 构象和构型两个术语不应混用 构型:在具有相同结构式的立体异构体中,取代基团在空间的相对取向。不同的构型如果没有共价键的破裂时不能互变的。 构象:指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态。构象的改变不涉及共价键的断裂。 4.1.3 蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次 蛋白质的一级结构 蛋白质的二级结构 蛋白质的三级结构 蛋白质的四级结构 6)结构成分---结构蛋白的单体一般聚合成纤维状如胶原蛋白。 7)支架作用---支架蛋白常含有多个不同的组件,在它上面可将多种不同蛋白质组装成一个多蛋白复合体,这种复合体参与对激素和其它信号分子的胞内应答的协调和

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