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珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中-药学学报
药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 20 13, 48 (4): 597 603 ·597 ·
稀细茎石斛LEAFY 同源基因的克隆及
在石斛药材鉴定中的意义
邢文瑞, 侯北伟, 管婧姣, 罗 晶, 丁小余*
(南京师范大学生命科学学院, 江苏 南京 2 10023)
摘要: 本文基于兰科已有的LEAF Y (LFY) 同源基因保守区设计引物, 对细茎石斛 (Dendrobium monilif orme
(L.) Sw.) 的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR 及Tail-PCR 技术得到LFY 同源基因——DenLFY , 全长
共3 575 bp, 包含3 个外显子和2 个内含子。将DenLFY 基因外显子序列提交到NCBI 进行BLAST 比对, 发现该
基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高, 均达 80% 以上, 其中与蝴蝶兰 (Phalaenopsis hybrid cultivar)
LFY 同源基因 (PhalLFY) 和文心兰 (Oncidium Gower Ramsey) LFY 同源基因相似度分别达84% 和90% 。应用
MP 的方法, 根据不同物种LFY 同源基因进行系统发生关系分析, 发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。
氨基酸序列比对分析结果表明, 该基因 C 端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY 基因外显子和内含子单独
分析来看, 外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY 基因功能的研究是一个开端, 而内含子2 在细茎石斛和
铁皮石斛 (Dendrobium offic inale Kimura et Migo) 中存在长度差异, 在石斛 材鉴定方面有着很大的应用潜力。
关键词: 细茎石斛; LEAFY 同源基因; Tail-PCR 技术; 序列分析
中图分类号: R93 1 文献标识码: A 文章编号: 0513-4870 (20 13) 04-0597-07
Sequence analysis of LEAFY homologous gene from
Dendrobium monilif orme and
application for identification of medicinal Dendrobium
*
XING Wen-rui, HOU Bei-wei, GUAN Jing-jia o, LUO Jing, DING Xiao-yu
(College of Life Sciences, Nanjing Normal University, Nanj ing 210023, China )
Abstract : The LEAF Y (LFY) homologous gene of Dendrobium monilif orme (L.) Sw. was cloned by new
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