生物多色发光的理论研究.pdf

中文摘要 生物多色发光的理论研究 随着自然科学的发展，人们对于一些自然现象的探索越来越深，从深海到 陆地的生物发光现象已引起众多化学家和生物学家的广泛关注。在这些发光生 物中，海洋中的水母以及陆地上的萤火虫是研究最多的两类生物，并且它们的 生物发光现象以被应用于临床诊断、环境保护、生物医学研究等各个领域。这 些越来越多的应用需求更加激励着科学家们更加深入地了解这些发光生物的发 光机理以及发光性质。 主要内容概括如下： 1．氧化腔肠素发光机理的动力学模拟与量化计算研究 采用动力学模拟与量化计算方法研究氧化腔肠素去质子化对光谱性质的影 响，以及两种终态——中性态与酚盐离子态的光谱性质。计算结果表明，理论 计算结果支持实验上提出的实验机理。在海洋生物发光组织内，一些蛋白质在 某一时刻的运动达到氧化腔肠素发生去质子化的条件，那么在这些蛋白腔内的 发光体为酚盐负离子形式，发光光谱对应荧光光谱中的低能发射峰。如果蛋白 的运动不足以达到氧化腔肠素的去质子化条件，则发光体形式为中性态，对应 荧光光谱中的高能发射峰。在质子由氧化腔肠素移向组氨酸 His22 的过程中， 前线分子轨道之间的能级差逐渐减小。酚盐负离子与中性态前线轨道上的电子 云分布在空间结构上具有较高的重叠度。分子静电势分析发现，去质子化后的 酚盐负离子中发生去质子化的羟基氧原子带有较高的电子密度，这有利于周围 氨基酸形成氢键。 2 ．发光水母发光蛋白微环境下：氨基酸与显性水分子对氧化腔肠素光谱性 质的影响作用 在疏水环境和水溶液中，研究 His16 ，Tyr82，Trp86，Phe113 ，Trp129，Tyr132， 显性水分子 Wat505 和 Wat405 对氧化腔肠素 CLM- 的光谱性质影响作用。在疏 水环境下，氨基酸或者显性水分子对吸收光谱没有明显的影响作用。由于Trp86 I - + 向CLM 靠近而改变了氢键网络。His16H +Trp86+Tyr82 可以通过氢键影响光谱 - 性质，Trp86 和 Tyr82 与CLM 之间的氢键会提高激发能并使发射光谱发生蓝移。分 - 子静电势分析发现，发光体 CLM 6 位的苯酚基中氧原子的电子密度最大，这有利 - + 于CLM 与His16H +Trp86+Tyr82 形成氢键，这是影响发射光谱的关键步骤。 3 ．萤火虫氧化荧光素类似物电子光谱和发光效率的理论研究 对萤火虫氧化荧光素(S)-2-(6-羟基-2-苯并噻唑基)-2-噻唑啉-4-酮(BTZ) 中苯 并噻唑环的 N 和 S 原子进行取代，形成一系列萤火虫氧化荧光素类似物，计算 氧化物中性态与羟基去质子化后的负一价离子态态在气相，水溶液和模拟生物 环境下的吸收与发射光谱，讨论环内不同取代原子对光谱的影响。结果表明： X1 位用 O 原子取代 S 原子的化合物的吸收最大值发生蓝移，用 N 原子取代 S 原子的化合物的吸收最大值发生红移.六个化合物轨道分布相似，HOMO 与 LUMO 重叠较大，有利于保持较高发光效率。去质子化增加苯环上 π轨道成份， 降低能隙，从而有利于提高电子跃迁几率，并使发射光谱红移。 通过 X1 和 X2 位不同原子取代，可以调节发射光谱向长波移动可达 44 nm ，向短波方向移 动可达 41 nm(在虚拟蛋白中) 。六种化合物发光范围较宽，振子强度较大，具有 较高的发光效率，可以作为新型底物应用于生物成像方面。 4 ．氨基荧光素，氧化荧光素荧光性质的 TD DFT 研究 萤火虫高效率的化学发光起源是一个热点研究问题，在萤火虫荧光素基础 上，发展设计更高效的荧光标记物对其在基因表达，基因调控，活体组织成像 等领域的应用有更为实际的意义。对氨基荧光素(AL) ，萘氨基荧光素(NAL)， 香豆素氨基荧光素(CAL)