基于细胞自动机的青霉素菌体生长可视化模型.pdfVIP

第30卷第3期 北京工业大学学报 Vd30N03 2004年9月 JoURNALoFBEUrNGUNⅣERSrIYOFTECHNoLoGY SeDL2004 基于细胞自动机的青霉素菌体生长可视化模型 于乃功，阮晓钢 (北京工业大学电子信息与控制工程学院，北京100022) 摘要：为了更好地反映出青霉素发酵过程中菌体生长的复杂系统特征，在对青霉素生长分批发酵过程菌体生 长机理研究基础上，建立了基于细胞自动机的青霉素分批发酵过程中菌体生长的可视化模型．模型采用二维彩 色图案描述了青霉素菌体的生长演化过程；模型演化规则建立在青霉素生产分批发酵过程菌体生长机理及其动 力学微分方程模型基础上，更加符合青霉紊分批发酵过程菌体生长演化行为的多样性、随机性和不确定性的特 点．仿真结果表明，该模型较好地描述了青霉素分批发酵过程中菌体生长的演化行为． 关键词：青霉紊分批发酵过程；菌体生长；可视化模型；细胞自动机 ll 中图分类号：TP 文献标识码：A 文章编号：0254一0037(2004)03一0290—05 青霉素发酵过程是一种复杂生化过程，微生物构成了青霉素发酵过程的基本要素，其生物活性相对简 单，然而，其形成的整个生化反应过程的动态行为复杂多变，其演化模式的多样性、随机性、不确定性，以及 对初始状态的敏感特性，均反映出青霉素发酵过程的复杂系统特征．目前的研究未能用复杂系统的观点 去认识和理解青霉素发酵过程，因而，所建立的各种模型(纯数学模型”。1、统计模型”“，、概念模型和神经 元模型”1“等)均未能表现出青霉素发酵过程的复杂演化特性，使基于这些模型的青霉素发酵过程最优控 制策略具有很大的局限性，与青霉素发酵过程优化的要求之间存在较大的差距．人工生命系统(如人工细 胞自动机等)是一种复杂系统，是自然生命系统的对偶系统．它为复杂系统建模、仿真与控制提供了一种 理想的生命计算模型，对于复杂系统建模、仿真和控制具有特殊的价值．研究表明，人工细胞自动机(简称 cA)具有表现复杂系统行为的能力。”1，这种能力使基于细胞自动机的青霉素发酵过程建模、仿真与控制 成为可能．作者在对青霉素生产分批发酵过程中菌体生长机理研究的基础上，结合菌体生长的动力学微 分方程设计了模型的演化规则，建立了基于细胞自动机的青霉素分批发酵过程中菌体生长的可视化模型 (biomass modelof batchfe衄ent撕on basedoncelllllar gmw山visualpellicillin process CABGM)． 1 CABGM设计‘101 采用三维细胞自动机作为青霉素菌体生长模型的生长空间，细胞自动机中的每一个细胞代表特定数 量的青霉素产生菌(菌体)，每一个细胞具有不同的状态．在细胞自动机中，菌体的生长演化过程就是细胞 自动机各个细胞在不同状态值之间不断转化的过程．基于cA的青霉素分批发酵过程菌体生长模型被定 义为一个五元组，如式(1)所示． (1) 状态的演化． 收稿日期：2003．05．09． 蕹害磊界；旱旁易爷羹盖葶乌蓦黎罨星努鼹瑶蹲％等目Ii掣；教育部科学技术研究重点资助项8(203002) 第3期 于乃功等：基于细胞自动机的青霉素菌体生长可视化模型 1．1 cABGM的离散时间 将青霉素分批发酵周期丁离散化，每一个离散时刻忙≈瓦．其中：女={O，1，2，…}为离散时间序列 Z为离散时间间隔． 1．2细胞和细胞空间 细胞是CABGM的基本元素，假设CABGM细胞是一 个微小的立方体，每一个细胞的边长设计为1mm，其全体 细胞排列成一个有规则的晶格结构构成CABGM的细胞空 间，如图l所示．CABGM的细胞空问由一个三维坐标系 0(f，，，≈)定位，位于(f，，，≈)的cABGM细胞记作 Cell(^，，≈)．其中，cABGM的某个顶点细胞被置于坐标 原点，记作cell(O，0，o)．因此，cABGM细胞空间可由式 (2)表示．