第3节 蛋白质-2.pdf

蛋白质的构象 蛋白质的构象 蛋蛋白白质质的的构构象象 蛋白质的结构、功能、性质之间的关系 构型与构象 构型与构象 构构型型与与构构象象 构型与构象 构型与构象 构构型型与与构构象象 基本概念： � 构型： 分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列 方式不同而使它呈现出不同的特定的立体结构。 � 构象： ( ) C-C 由于分子中的某个原子 基团 绕 单键自由旋转而 形成的不同的暂时性的易变的空间结构形式。 根本区别： 构象的转变不涉及共价键的断裂，只是单键的旋转。 蛋白质立体结构原则： 蛋白质立体结构原则： 由于 双键中的π电子云与 原子上的未共用电子对发 a. 由于 双键中的π电子云与 原子上的未共用电子对发 a. C=O N C=O N aa.. 由由于于 双双键键中中的的ππ电电子子云云与与 原原子子上上的的未未共共用用电电子子对对发发 CC==OO NN 生 电子共振 ，使肽键具有部分双键的性质，肽键不能 生 电子共振 ，使肽键具有部分双键的性质，肽键不能 “ ” 生生 电电子子共共振振 ，，使使肽肽键键具具有有部部分分双双键键的的性性质质，，肽肽键键不不能能 “ ” ““ ”” 自由旋转。 自由旋转。 自自由由旋旋转转。。 与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构。但由于 碳原 α 与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构。但由于 碳原 b. α 与与肽肽键键相相连连的的六六个个原原子子构构成成刚刚性性平平面面结结构构。。但但由由于于 碳碳原原 b. αα- bb.. - -- 子与其他原子之间均形成单键，因此相邻的平面结构可 子与其他原子之间均形成单键，因此相邻的平面结构可 子子与与其其他他原原子子之之间间均均形形成成单单键键，，因因此此相相邻邻的的平平面面结结构构可可 以作相对旋转。 以作相对旋转。 以以作作相相对对旋旋转转。。 相邻肽平面的相对旋转 相邻肽平面的相对旋转 二面角(dihedral angle) ： (dihedral angle) ((ddiihheeddrraall aannggllee)) Cα 两相邻酰胺平面（肽平面）之间，能以共同的Cα为定点而 CCαα