惠州市手足口病病原构成及肠道病毒71型VP1基因序列分析.pdfVIP

中国卫生检验杂志 2014年 10月第24卷第20期 ChinJHealthLabTee，Oct2014，Vol24，No20 ·2957· · 分子诊 断与基 因检测 · 惠州市手足 口病病原构成及肠道病毒71型 1基因序列分析 琚雄飞 ，甘爱华 ，何伟锋 1．惠州市疾病预防控制中心，广东 惠州516003；2．惠州市整合医学重点实验室，广东 惠州 516001 摘要 ：目的 探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型(Enterovirus71，EV71)的分子特征 ，为手足口病 的综合防治提供科学依据。方法 采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料 ，通过realtimeRT — PCR方法确定肠道病毒型别 ，对EV71型分离株进行VP1片段测序，测序结果利用 DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸 序列分析和同源性比较 ，并用Mega5．0软件构建系统发生树。结果 通过realtimeRT—PCR特异性检测发现，EV71、 CoxA16和其他肠道病毒的阳性率分别为56．69％(284／501)、10．38％(52／501)、13．17％(66／501)。测序结果表明 12 株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97．9％ ～99．6％，氨基酸同源性为99．3％一100％。构建系统发生树 表明，12株病毒基因与 C基因型代表株与 C4基因亚型最为相近，并且可进一步划分为C4a进化枝。说明本研究的12 株病毒皆属于 EV71病毒C基 因型、C4a亚型。结论 EV71和 CoxA16是本地区手足 口病的主要病原体，因此加强 EV71和CoxA16的监测特别是EV71的检测，有助于更好地预防和控制手足口病。EV71型惠州分离株均属于c4基因 亚型的C4a进化分支，与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致。 关键词：手足口病；肠道病毒71型；CA基因亚型；VP1区 中图分类号：R512．5 文献标识码：A 文章编号：1004—8685(2014)20—2957—05 Etiologyofhandfootandmouth diseaseandgeneticanalysisofthe P1 region ofenterovirus71inHuizhou ju Xiong—fei ，GAN Ai—hua，HEWei—feng HuizhouCenterforDiseaseControlandPrevention，Huizhou516003，China Abstract：Objective Tounde~tandtheetiologicalcharacteristicsofhandfootandmouthdisease(HFMD)andthemolecular epidemiologicalcharacteristicsofenterovirus71(EV71)inHuizhou，andtoprovideevidenceforscientificcontrolandpreven— tionofHFMD．Methods Specimensandrelatedclinicaldatawerecollectedfrom501suspectedHFMDcases．Real—timeRT — PCR was。carriedoutfortheidentificationandtypingofenterovirus．VP1genesoftheEV71isolatesweresequenced．And DNAStarwasusedtoanalyzetheresults，especiallythedegreeofnucleotidesequenceandaminoacidsequenceandtocompare