三维氨基酸描述子(svtd)在hla-a0201限制性ctl表位肽qsar中的应用 the application of a 3d-descriptor of amino acids-svtd in qsar of hla-a0201 restricted ctl epitope.pdfVIP

第28卷第1期 计算机与应用化学 V01．28，No．1 and 1 2011年1月28日 ComputersAppliedChemistry January,201 表位肽QSAR中的应用 陈婷2，李美萍1，张生万¨ (1．山西大学生命科学学院，山西，太原，030006：2．山西大学化学化工学院，山西，太原，030006) 摘要：应用新型的三维氨基酸描述子．SVTD对65个HLA-A‘0201限制性CTL表位肽进行结构表征。通过多元线性回归对其结 构与活性的关系建立定量构效关系QSAR模型，采用内外双重验证的办法分析验证模型的稳定性，建模计算值，留一法 够系统地表征肽与生物活性相关的结构，且所产生的定量构效关系模型。预测HLA．A‘0201活性的能力较好，可以为改造CTL 表位肽结构提供理论基础。 关键词：三维氨基酸描述子SVTD，表位肽，多元线性回归