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分子克隆及细胞培养基本实验方法
分子克隆及细胞培养基本实验方法
载体构建实用操作技术
1.1菌种的保存—20%甘油菌
2体积菌液与1体积70%的甘油混合后,储存于-20℃或-70℃备用。(甘油菌中甘油的浓度为20-30%均可)
1.2甘油菌复苏、培养
方法一、挑取甘油菌一环,接种在含100ug/ml Amp的LB固体培养基上(活化菌种),37℃培养过夜(约16小时);挑取一个菌落转接在含100ug/ml Amp的LB液体培养基中,37℃振荡过夜(约12~16小时)。
方法二、直接吸取10~20ul甘油菌,接种在含100ug/ml Amp的LB液体培养基中,37℃振荡过夜(约12~16小时)。
1.3小规模制备质粒DNA(QIA miniprep kit )
适于从1~5ml 菌液中制备20ug高拷贝质粒
⑴收集菌液,离心1000rpm,1分,弃上清
⑵以250ul P1重悬细菌(P1中已加RNase)
⑶加入250ul P2,颠倒4~6次轻混,约2~3分(轻混以免剪切基因组DNA,并免长时间消化)
⑷加入350ul N3,迅速颠倒4~6次轻混;离心10分,13 000rpm
⑸上清入QIAprep柱,离心30~60秒,滤液弃之
⑹加入0.5ml PB洗,离心30~60秒
⑺加入0.75ml PE洗,离心30~60秒,弃滤液,再离心1分
⑻换新管,加入50ul EB,静置1分(EB 37℃ 预热),离心1分。
1.4酶切反应
⑴体系构成(反应体系尽可能小!)
pGEM3ZF-huCTLA4-Ig(ul) pAdTrack-CMV(ul) ①dd.H2O 17 17 ②10×NEbuff 2 3 3 ③10×BSA 3 3 ④底物DNA 5 5 ⑤内切酶 HindⅢ 1 1 XbaⅠ 1 1 Total : 30 ul 30ul
⑵37℃水浴1~2小时,必要时延长酶切时间至12小时
⑶酶切2小时后,取5-10ul 电泳观察酶解是否完全
⑷65℃灭活内切酶
⑸-20℃保存备用
1.5回收目的片段(QIAquick Gel extraction Protocol)
胶,尽可能去除多余的胶,称重;
加入适量buff QG(300ul QG /100mg胶);2%的胶,应加大QG用量(600ul QG /100mg);
水浴50℃,10min,每2-3min混匀一次,使胶完全溶解!必要时延长水浴时间,胶完全溶解后混合物颜色应为黄色,与buff QG 相似;
当DNA片段在500bp或4kb时,应加入异戊醇100ul/100mg胶,以提高产物量。此步不离心。DNA片段在500bp~4kb时,加入异戊醇并不能提高产量;
结合:将混合物转入QIAquick柱,离心13000rpm,1min;(柱容量800ul/次);
洗:0.75ml buff PE,离心13000rpm,1min;(DNA用于盐敏感操作时,如平端连接、直接测序,加入PE后静置2-5min);弃离心液,再离心13000rpm,1min,以去除剩余的乙醇;
将QIAquick柱置于一清洁的1.5ml Ep管,加入30~50ul buff EB或H2O (滴于QIAquick 膜上!),静置1min,离心15000rpm,1min;
-20℃保存备用。
1.6连接反应
⑴体系构成(反应体系20ul,载体:目的片段=1:3-5,摩尔数比)
反应组份 数量(ul) ①dd.H2O 8 ②T4 10×buff 2 ③载体DNA(ul) 1 目的片段(ul) 8 ④T4DNA连接酶 1 Total : 20 ul
⑵16℃水浴12-16小时(过夜)
⑶直接用于转化或-20℃保存备用
1.7感受态细胞的制备
菌种10-20ul入5ml LB液体培养基(不加Amp),37℃振摇4-6 hr,至中对数期;
菌液冰浴10min,分装2管,离心(4℃,4 000-6 000rpm)收菌;
弃上清,将菌体悬浮于800ul 0.1M CaCl2(冰预冷)中,冰浴10min,离心(4℃,4000-6000rpm);
再将菌体悬浮于200ul 0.1M CaCl2(冰预冷)中,冰浴,12-24hr可用。菌体沉淀时,重悬操作要轻。
1.8转化
新鲜感受态细胞200ul,加入2-10ul连接产物,轻轻旋转混合,冰浴30-60min;
42℃热休克90sec,勿摇动试管,再冰浴2min;
加入液体LB培养基(无抗生素)800ul,37℃温和振摇45-60min;
离心4000-6000rpm,2min,弃去900ul上清;
剩余物重悬细菌,铺 Amp板,平放20min,倒置培养10-14hr。
1.9鉴定重组子
常规PCR法鉴定重组
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