基因表达与功能分析的基本策略-武汉大学基础医学院.pdf

基因结构与功能 分析的基本策略 喻红 武汉大学基础医学院生化系 2017/3/28 问 题 ？ A B 利用比较蛋白质组学从某一病理组织中检测 到一种新的蛋白质，下一步？ 探讨相关基因结构与功能，请设计研究方案及相关方法 Main Contents 基因结构与功能分析概述 基因结构与功能的生物信息学分析 基因启动子及调控序列的结构分析 基因编码区结构分析方法 基因功能分析方法 2017/3/28 基因结构与功能的研究策略 新基因 新蛋白 生物信息学的分析与预测 序列同源性比对、查找、定位、功能预测 新基因结构研究 新基因功能研究 基因编码区结构分析 基因启动子等调控序列分析 ！？ cDNA 文库分析 启动子克隆 cDNA 克隆测序 转 编 qPCR—基因拷贝数 启 足迹法 录 cDNA末端快速扩增(RACE) EMSA 码 FISH-定位及拷贝数 动 起 Deep-RACE ChIP 区 DNA芯片及SNP 芯片 子 始 5’端连续分析基因表达(5’SAGE) 报告基因 RNA剪接分析 点 帽分析基因表达(CAGE) 启动子捕获 第四节 基因功能分析策略 Strategies for Analyzing Gene Function 2017/3/28 基因功能研究技术策略的演绎 基因功能分析即从细胞的生物学行为或生物个体的表型 遗传性状的变化鉴定基因的功能。 Northern blot， 1977 Western blot， 1979 mRNA检测 基因表达序列标签(EST), 1980s’ 基因表达分析 PCR，1986 蛋白水平检测DNA/EST/mRNA数据库，1990s’ 生物芯片：基因表达谱检测，本世纪初 …… 功能获得策略 基因生物学功能鉴定技术 功能失活策略 转基因、基因打靶技术 随机突变筛选策略