基于illumina测序技术的IGROV-1CP细胞中miRNA种类鉴定和相对丰度分析.pdfVIP

第28卷第2期 分析测试学报 VoL28No．2 FENXICESHI ofInstrumental 129—134 2009霉2秀 XUEBAO(JoumalAnalysis) 帝、-片忻∞、擀∽、-／审{箭 l研究报告i 格斗s，譬占乍州、$臂过^、!—嘲 ROV一_l／CP细胞中 基于illumina测序技术的lG mi RNA种类鉴定及相对丰度分析 张政希‘，莫 凡2，郭 妍1，徐学敏’，林标扬‘，李 伟1 ({．上海交逶大学系统生物医学骄究院，上海200240；2．浙汪大学澈汪攘髑酾际绒米技术 研究院，浙江杭州310029) 序平台对上述cDNA文烨进行测序。从测序获得的序列数撼中去除冗余数据詹，与已知人类miRNA序列数撂 度差骅不大干2和无碱蕊错酏为限制条件，共找到53种巴知miRNA。梭在eDNA文库测序中的出现频率汁 技术麓够在检溅细跑泠的各种小RNA黟凋的阏精反应辅砖誊度信息，该辫究剩溺上述耨技本获褥了腰镰嚣垂 药性IGROV．I／CP细胞系miRNA表达种类翻榴对丰度的爽验数据。 关键谲：辩巢癌；橛铺辩药健；IGROV一1／CP缩胞系；miRNA；illumina灏廖技术 中圈分类号：R737．31文献标识码：A 文章编号：1004—4957(2009)02—0129—06 ofmi狡NA andTheirRelativeAbundancein重G狡0V．1／CP Analyses Species na Cells Illumi Technology Using Sequencing ZHANG Weil Fan2，GUOYan’，XUXue．minl，LINBiao-yan91，LI Zheng．xil，MO for (1．Institute JiaotongUniversity，Shanghai SystemsBiology，Shanghai International 310029，China) NanoSystemsInstitute，ZhejiangUniversity，Hangzhou cellswas constructa Abstract：Smal|RNAextractedfrom culturedIGROV．1／CP usedto regularly cDNA cDNAs fromsmallRNAwere anillumina derived library．The sequencedusing generalsequen— wereremovedandthe were the cingplatform．Redundantsequences sequencesintercomparedagainst