应用基因芯片检测中国野生葡萄抗白粉病基因表达-园艺学报.pdfVIP

应用基因芯片检测中国野生葡萄抗白粉病基因表达-园艺学报.pdf

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维普资讯 园 艺 学 报 2008,35 (7):1053—1058 ActaHorticuhuraeSinica 应用基因芯片检测中国野生葡萄抗 白粉病基因表达 张军科,桑春果 ,王跃进一 ,张朝红,史江莉,粟 霞,罗世杏 (西北农林科技大学园艺学院,农业部西北园艺植物种质资源与遗传改良重点开放实验室,陕西杨凌712100) 摘 要:研究了利用Aflymetrix的欧洲葡萄基因表达芯片检测中国野生葡萄基因表达的可行性,并检 测了葡萄白粉病菌 (Uncinularnecator)人工接种诱导48h后的基因表达情况。结果表明:该芯片可以在感 病材料中检测出表达的基因11906个,抗病材料中检测到表达的基因 11839个,在二者中同时检出表达的 基因 11839个,能够检出的基因数 占该芯片基因探针组总数的71.3%,因此用欧洲葡萄基因芯片检测中国 野生葡萄中基因表达水平是可行的;利用此芯片检测出在人工接种诱导后 ,抗病材料中和感病材料相比表 达上调的基因共 1920个,占检测出基因总数的l6.2l%;表达下调的基因数 1760个,占检测出基因总数 的14.87%;表达上调和下调的幅度 (signallogratio)都在 1—7倍之间。 关键词:葡萄;基因芯片;抗病基因;基因表达 中图分类号:S663.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X (2008)07—1053-06 Expression ofPowdery M ildew ResistantGenesofChineseW ild Vitis by M icroarrayAnalysis ZHANGJun-ke,SANG Chun-guo ,WANGYue-jin ,ZHANG Chao-hong,SHIJiang—li,SUXia,and LU0 Shi-xing (CollegeofHorticulture,NorthwestAFUniversity,KeyLaboratoryofNorthwestHorticulturalPlantGermplasm andGenet~ ImprovememofMin~tryofAgriculture,Yangling,Shaanxi712100,China) Abstract:ThefeasibilityofusingAffymetrixVitisviniferageneexpressionmieroarraytodetectthegene expressionofChinesewildgrapewasstudied,andthegeneexpression after48hartificialinoculationwith Uncinularnecatorwasdetected.Theresultsshowed thatthemieroarraycan detecttheexpressionof11906 genesinsusceptiblematerial(S),while11839genesinresistantindividual(R)and11839genesinbothR andS.Thedetectedgenesaccountedfor71.3% ofthetotal16602probegroups.ThatmeansAffymetrix vinfieramieroarraycanbeefficientlyusedofrgeneexpressionanalysisofChinesewildgrapes.Comparedtothe Splant, 1920 up-regulated and 1760 down-regulated geneswere detected in R plant,accounting ofr l6.2l%and14.87% oftotaldetectedgenesrespectively,up-anddown-reuglatedrate(signallogratio)are among 1to7. Keywords:grapevine;genemicroarray;diseaseresistancegene;geneexpression 目前世界上主要的酿酒葡萄和鲜食葡萄品种都属欧亚种 (Vitis

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