利用基因组步行方法克隆柑橘黄龙病病原菌亚洲种序列-园艺学报.pdfVIP

园　艺 　学 　报 　2009 , 36 (4) : 493 - 500 A cta Horticu lturae Sin ica 利用基因组步行方法克隆柑橘黄龙病病原菌亚洲种 序列 1, 2 1, 3 2 3 1 2 廖惠红 , 李杨瑞 , 彭宏祥 , 白先进 , 杨丽涛 , 徐 　宁 (1 广西大学农学院 , 南宁 530004; 2 广西农业科学院园艺研究所 , 南宁 530007; 3 广西作物遗传改良生物技术重点开 放实验室 , 南宁 530007) 摘 　要 : 对 NCB I基因库黄龙病亚洲种病原菌序列进行拼接 , 并根据拼接结果在 rp lKAJL rp oBC, 16 S/ 23S rRNA 和 omp 3个位点上设计引物 , 采用基因组步行方法 , 在其亚洲种 3个位点上共获得了 15 168 bp 非 冗余新序列 , 其中 , 在 rp lKAJL rp oB C位点上 5 端′上游区和 3 端′下游区分别获得了 3 2 18和 2 653 bp 的非冗 余新序列 ; 在 16S/23 S rRNA 位点上 5 端′上游区和 3 端′下游区分别延伸了 1 853 和 2 459 bp 的新序列 ; 在 omp 基因位点上分别获得了 4 014和 97 1 bp 的新序列 。序列分析表明在 rp lKAJL rp oBC位点上的新序列包含 2个新基因 ( suhB 和 serA ) ; 16 S/23S rRNA 位点新序列包含 4 个新基因 (膜转运蛋白基因、细胞壁脱氢酶 M et ) ( ) 假基因、5 S rRNA、tRNA , omp 位点新序列包含 6个新基因 rpsB、tsf 、py rH、f rr、cdsA2、cds2 。这些 新序列的获得为以 PCR 为基础的黄龙病相关研究提供了有用的参考依据 。 关键词 : 柑橘 ; 黄龙病 ; Cand ida tus L iberibactor; 序列 中图分类号 : S 666　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 0513353X (2009) Sequences C lon ing of C an d ida tu s L iber ibactor a sia ticu s A ssoc ia ted w ith Huanglongb ing U sing Genom ic W a lk ing M ethod 1, 2 1, 3 2 3 1 2 L IAO Hu ihong , L I Yangru i , PEN G Hongxiang , BA I X ianj in , YAN G L itao , and XU N ing (1A g ricu ltu re Colleg e, Guangx i Un ivers ity, N ann ing 5