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表达谱芯片常见问题 上海欧易生物 技术支持部 表达谱芯片常见问题 目 录 1. 什么是基因芯片？2 2. 表达谱芯片的实验目的？2 3. 欧易生物如何保证表达谱芯片服务的质量？2 4. 欧易生物是否获得服务认证？2 5. 欧易生物可以提供哪些物种的表达谱芯片检测服务？3 6. Agilent 和Affymetrix 芯片的探针设计原则？3 7. 表达谱芯片检测的实验流程？4 8. 如何确保用来杂交的样品能够与芯片上的探针充分结合？是否存在过饱和问题？4 9. 表达谱芯片检测一个样品的RNA 量？4 10. 组织、细胞或者血液分别需要多少用量？如何进行运输？4 11. 样品该如何收集与处理？4 12. 血液样本的取材有哪些注意事项？4 13. 生物学重复是必须的吗？一般要重复几次？4 14. 技术重复是必须的吗？一般应重复几次？5 15. 如何判断一个芯片检测结果的好坏？5 16. 芯片的变异系数（CV 值）怎么解释？5 17. 对于全基因组基因芯片，我们一般可以得到多少基因的表达信息？5 18. 表达谱芯片数据分析包含哪些内容？5 19. 欧易生物提供的表达谱芯片报告内容有哪些？5 20. 表达谱芯片与qPCR array 和转录组测序的区别？6 21. 样品RNA 线性放大是否会提高检出率？6 22. 通常大多数基因的长度在 1.5-2Kb 之间，有的甚至更长，但很多芯片在设计上采用 60-70mer 的Oligo 探针来代表一条基因，请问它们能具有这样的代表性吗？设计这样的探针 的原则是什么？7 23. 做了基因芯片后，是否需要进行聚类分析？7 24. 客户选择的验证基因在芯片上差异不显著，即没有满足FC=2 ，P=0.05 的筛选标准。 7 25. 定量验证所用的样品和芯片检测的不一致，定量结果与芯片不一致。8 26. 做完表达谱芯片后，在众多的差异基因中如何确定后期研究目标？8 27. 后期数据分析是否可以无限次呢？8 28. mRNA 是否可以进行临床意义分析呢？8 1 表达谱芯片常见问题 1. 什么是基因芯片？ 基因芯片 （Gene chip ）又称为DNA 微阵列 （DNA microarray），其基本原理是将众多的 靶基因序列或寡聚核苷酸片段有序而高密度地排列在玻璃、硅、尼龙膜等固相载体上，用标 记好的待检测样本与之杂交，并利用激光共聚焦显微扫描等技术对芯片上成千上万的杂交信 号进行实时、灵敏而准确的检测，辅以计算机统计分析从而得到样本的基因表达信息。目前 基因芯片技术已广泛运用于生物学与医学的基础研究、疾病诊断、新药开发、环境保护等许 多方面。 2. 表达谱芯片的实验目的？ 表达谱芯片是一种高通量检测技术，用于在全基因组水平检测某生物学现象中所有基因 的表达量变化，进而发现变化明显的标志性基因。 3. 欧易生物如何保证表达谱芯片服务的质量？ 进口的配套试剂：所有的试剂都是进口的配套试剂，充分保证实验的准确性和稳定性； 完整的硬件系统：配备芯片检测所需的所有仪器，包括杂交炉、扫描仪、2100 样品质 控系统等； 专业的技术操作人员：八年表达谱芯片实验的操作经验；专业的生物信息分析团队，熟 悉各种分析算法和软件； 更高的服务标准：采取严格的质量标准、多重实验质控和完备的实验记录，确保更高的 成功率、更低的样品损失及实验失败风险，并且客户可以参与整个芯片实验过程，接受客户 监督，更加透明和可信； 更个性化的生物信息分析服务：与客户充分互动，提供更多个性化分析思路和分析方 案； 完善的后续验证支持：持续专注于mRNA 的定量检测，为上千位客户提供过相关服务； 严谨的科学作风：尊重科学、尊重事实、务求严谨、绝不弄虚作假； 优秀的服务理念：核心团队平均10 年以上技术服务领域工作经验，均具备良好的职业 操守及服务客户理念。 4. 欧易生物是否获得服务认证？ 欧易生物是