拟南芥中缺铁反应性micrornas的鉴定-中国生物化学与分子生物学报.pdfVIP

ＩＳＳＮ　 １００７⁃７６２６ 中国生物化学与分子生物学报　 ｈｔｔｐ：／ ／ ｃｊｂｍｂ．ｂｊｍｕ．ｅｄｕ．ｃｎ ２０１４年３月 ＣＮ　 １１⁃３８７０／ Ｑ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ３０（３）：２９１～２９７ 拟南芥中缺铁反应性ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ 的鉴定 李　 华，　 郜明泉，　 苏小雨，　 赵会杰∗ （河南农业大学生命科学学院，郑州　 ４５０００２） 摘要　 ｍｉｃｒｏＲＮＡ是一种非编码蛋白质的小分子ＲＮＡ，参与了植物生长发育及环境胁迫响应的调 控，主要通过对靶基因的负调控去影响生物学过程．基于前人对拟南芥全基因组ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ及其靶 基因的预测，我们找到了靶向１５ 个缺铁响应基因的２２ 个ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ（ｍｉＲ１５８ａ、ｍｉＲ１６４ｃ、ｍｉＲ１７２ａ、 ｍｉＲ１８８７、ｍｉＲ２１１１ａｂ、ｍｉＲ３９３３、ｍｉＲ３９５ａｄｅ、ｍｉＲ４１４、ｍｉＲ８２８、ｍｉＲ８３１、ｍｉＲ８３７⁃３Ｐ、ｍｉＲ８３７⁃５Ｐ、 ｍｉＲ８５４ａｂｃｄ、ｍｉＲ８５７、ｍｉＲ８６１⁃５Ｐ、ｍｉＲ８６４⁃５Ｐ）．对这些ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ 的启动子进行分析，发现分别有 １７、１０和４ 个ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ启动子中包含缺铁响应元件ＩＤＥ１、生长素响应元件和乙烯响应元件．进一 步通过Ｐｏｌｙ（Ｔ） ａｄａｐｔｏｒ ＲＴ⁃ＰＣＲ方法对这２２ 个ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ在缺铁条件下的表达变化做了检测，结 果显示，除ｍｉＲ１５８ａ和ｍｉＲ８３７⁃５Ｐ外的２０ 个ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ在缺铁条件下的表达变化都有显著差异， 且具有时间依赖性． 这２０ 个ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ可作为缺铁响应的候选ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ． 关键词　 缺铁；ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ；拟南芥 中图分类号　 Ｑ７ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ Ｒｅｓｐｏｎｓｅｄ ｔｏ Ｉｒｏｎ Ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ ｉｎＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ＬＩ Ｈｕａ，ＧＡＯ Ｍｉｎｇ⁃Ｑｕｎ，ＳＵ Ｘｉａｏ⁃Ｙｕ，ＺＨＡＯ Ｈｕｉ⁃Ｊｉｅ∗ （Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，ＨｅｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｚｈｅｎｇｚｈｏｕ　 ４５０００２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ　 ｍｉｃｒｏＲＮＡ （ｍｉＲＮＡ）ｉｓａｎｏｎ⁃ｐｒｏｔｅｉｎ⁃ｃｏｄｉｎｇｓｍａｌｌｍｏｌｅｃｕｌｅＲＮＡ （ｓｍａｌｌ ＲＮＡ），ｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｒ ｓｔｒｅｓｓ ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ｍａｉｎｌｙ ｔｈｒｏｕｇｈ ｎｅｇａｔｉｖｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｔａｒｇｅｔ ｇｅｎｅｓ ｔｏ ｉｎｆｌｕｅｎｃｅ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓｅｓ． Ｂａｓｅｄ ｏｎ ｐｒｅｖｉｏｕｓ ｇｅｎｏｍｅ⁃ｗｉｄｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ａｂｏｕｔ ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｔａｒｇｅｔｓ ｉｎ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ， ｗｅ ｆｏｕｎｄ ２２ ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ （ｍｉＲ１５８ａ， ｍｉＲ１６４ｃ， ｍｉＲ１７２ａ， ｍｉＲ１８８７， ｍｉＲ２１１１ａｂ， ｍｉＲ３９３３， ｍｉＲ３９５ａｄｅ， ｍｉＲ４１４， ｍｉＲ８２８， ｍｉＲ８３１， ｍｉＲ８３７⁃３Ｐ， ｍｉＲ８３７⁃５Ｐ， ｍｉＲ８５４ａｂｃｄ，ｍｉＲ８５７，ｍｉＲ８６１⁃５Ｐ，ｍｉＲ８６４⁃５Ｐ）ｔａｒｇｅｔｉｎｇ １５ ｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄｔｏ ｉｒｏｎ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ． Ｐｒｏｍｏｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ １７， １０ ａｎｄ ４ ｍｉｃｒｏＲＮＡｓ ｅｘｉｓｔｉｎｇ ｉｒｏｎ ｄｅｆｉｃｉｅｎｔ ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅ ｅｌｅｍｅｎｔ １ （ＩＤＥ１），ａｕｘｉｎ ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅ ｅｌｅｍｅｎｔ ａｎｄ ｅｔｈｙｌｅｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅ ｅｌｅｍｅｎｔ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ． Ｆｕｒｔｈｅｒ，Ｐｏｌ