齐口裂腹鱼白介素-1β基因的克隆及表达谱-生物技术通报.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN ( ) 2017, 33 2 :97-101 齐口裂腹鱼白介素 -1β基因的克隆及表达谱 1 2 段荟芹  王利 （1. 西南民族大学青藏高原研究院，成都 610041 ；2. 西南民族大学生命科学与技术学院，成都 610041） 摘 要 ： 探讨齐口裂腹鱼白介素-1β （Interleukin-1β ，IL-1β ）基因的基本特点。用RT-PCR 方法以齐口裂腹鱼脾脏cDNA 作 为模板扩增IL-1β 基因，用生物信息学软件分析其序列，用RT-PCR 方法检测IL-1β 基因在齐口裂腹鱼6 种组织的表达情况。克隆 获得的IL-1β 序列长 1 252 bp，共编码276 个氨基酸。GenBank 序列号为KU886235。IL-1β 蛋白相对分子量为31.25 kD，等电点5.45， 预测为亲水性蛋白。二级结构主要结构元件为随机卷曲和延伸链，有4 个N- 糖基化位点和16 个磷酸化位点。NJ 法系统进化树显示， 齐口裂腹鱼与鲤鱼、鲫鱼的亲缘关系最近。组织表达分析显示，IL-1β 基因主要在脾脏和肾脏中表达。这为深入研究鱼IL-1β 的生 物学功能提供理论依据。 关键词 ： 齐口裂腹鱼；白介素-1β ；克隆 ；蛋白质分析 ；基因表达 DOI ：10.13560/ki.biotech.bull.1985.2017.02.014 - β Cloning and Expression Profile of Interleukin 1 Gene in Schizothorax prenanti 1 2 DUAN Hui-qin WANG Li - （1. Institute of Qinghai Tibet Plateau ，Southwest University for Nationalities ，Chengdu 610041 ；2. College of Life Science and Technology ， Southwest University for Nationalities ，Chengdu 610041 ） Abstract: This work aims to characterize interleukin-1β （IL-1β ）gene of Schizothorax prenanti. First，RT-PCR was used to amplify IL-1β gene with cDNA of S. prenanti spleen as template. Then，the IL-1β gene sequence was analyzed with various bioinformatics tools，and the expressions in 6 tissues of S. prenanti were detected used RT-PCR. As results，the length of IL-1β gene was 1 252 bp，and it encoded 276 amino acids. Its GenBank