准噶尔小胸鳖甲短时低温胁迫响应的转录组分析-昆虫学报.pdfVIP

昆虫 学 报 准噶尔小胸鳖甲短时低温胁迫 响应的转录组分析 库尔班 吐松 陆雪莹 刘小宁 马 纪 新疆大学生命科学与技术学院 新疆生物资源基因工程重点实验室 乌鲁木齐 摘要 目的拟步甲科昆虫小胸鳖甲 是分布于中国新疆古尔班通古特沙漠 的特有物种具有很强的耐寒性但其低温响应的分子机制尚不明确 本研究旨在利用转录组测序 技术丰富小胸鳖甲的已知基因信息分析在短时低温胁迫下上调表达基因的主要类群及参与的主 要代谢通路 方法利用软件对分别在 低温和 对照下处理 的小胸鳖甲成 虫 数据进行从头组装利用软件进行基因注释 通过 和 软件分 析差异表达基因并对上调表达基因进行和 代谢途径富集分析 结果测序过滤后得到 个有效读序 个平均 长度为 的非冗余基因其中 个基因约 有同源序列 与拟 步甲科的赤拟谷盗相应基因相似性最高核苷酸序列一致性为 低 温响应上调表达基因有 个富集到 个类群 个途径 其中胁迫响应类群生物 调节类群和免疫系统过程类群都占有重要比例嘌呤代谢硫胺素代谢糖酵解糖异生等代谢通路 显著富集 在胁迫响应类群中热激蛋白 基因超氧化物歧化酶基因和钙联接蛋白 基因等 个非生物胁迫相关基因显著上调表达 结论荒漠昆虫小胸鳖甲低温转录组揭 示在 冷驯化过程中代谢过程胁迫响应生物调节和免疫系统等生物学过程相关基因表达显 著上调其中几个非生物胁迫响应基因提示小胸鳖甲可能从分子伴侣细胞周期阻滞线粒体稳定 性抗氧化胁迫等多方面应对低温胁迫 富集分析所揭示的小胸鳖甲在低温下的转录组代 谢通路与其他物种有较大差异 研究结果为后续生物信息学分析及小胸鳖甲耐寒关键基因的发掘 及耐寒机制的揭示提供了基础数据 关键词 小胸鳖甲 低温胁迫 冷驯化 转录组 差异基因 中图分类号 文献标识码 文章编号 基金项目 国家自然科学基金项目 作者简介 库尔班 吐松 男 年生 新疆温宿县人 博士研究生 研究方向为昆虫低温分子生物学 通讯作者 收稿日期 接受日期 昆虫学报 卷 昆虫占地球动物种类的 以上存在于几乎