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- 2018-11-27 发布于天津
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利用基因晶片剖析水稻根部系统-发育与生理-华联生物科技
科技
science topics 專題
利用基因晶片剖析水稻根部
系統-發育與生理
第九屆國際水稻功能基因體研討會將於 11 題。此篇研究以訊號超過 50 且有出現在任三片資
月 7‐9 日於台灣中研院舉行,在全球稻米出口量最 料中就保留該基因,為以取最多基因數為前提下進
大國-泰國遭逢半世紀以來最嚴重的水患之際,糧 行資料分析。
食危機已不再是竦動的標題,而是人人必須正視的
議題。在七月號的華聯快訊中,我們曾介紹日本農
業研究中心以實地探討農田中的水稻的基因表達
情形,建立一個 RiceXPro (http://ricexpro.dna.affrc.g
o.jp/) 的網站。在 2011 年九月該團隊發表了最新
研究,以基因晶片為工具進行根部的 Genome‐wide
transcriptome 研究,根部是第二次綠色革命中的關
鍵角色,此大型研究可協助學者更了解根在發育與
生理功能的角色。華聯在 2011 年亦推出水稻基因
晶片與模式植物的 miRNA 晶片,旨在協助水稻專
家們進行大規模的實驗,探討逆境生理的調控機制
圖一
與輔助尋找抗逆境的生物標誌。
樣品部位描述
(a) 冠狀根分為 8 區代表不同發育時期 (R0-R7) 。 LR, lateral
root; LRP, lateral root primordium 。
實驗設計與資料品質 (b) 冠狀根在 R2R3 與 R7 的橫切面圖,代表取樣部位的組織
日本團隊利用 laser microdissection 技術,將
形態,分別為 EpiExo (epidermis/exodermis/sclerenchyma) 、
冠狀根 (crown root) 自縱軸分成8 區 (R0‐R7) 、橫
Cortex (cortex with approximately three layers)與 EndStele
軸分成3 區 (EpiExo 、Cortex 與 EndStele) 進行特定
(endodermis/pericycle/stele) 。
組織取樣,其中僅在 R2R3 與 R7 兩個發育時期有
取 EpiExo 、Cortex 與 EndStele 等部位 (見圖一)1 , 華聯生技服務報告的 PCA (principle
而 R7 之 Cortex 區域因為富含 aerenchyma component analysis) 可協助客戶依據樣品間的距離
(non‐living cells) ,而未進行基因晶片實驗。除了 R7
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