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第31 卷 第3 期 经 济 林 研 究 Vol. 31 No.3
2013 年9 月 Nonwood Forest Research Sep. 2013
山核桃EST-SSR引物的筛选及通用性分析
1,2 2 1 1
黄少勇 ,张智俊 ,罗淑萍 ,李 疆
(1. 新疆农业大学,新疆 乌鲁木齐 830052 ;2. 浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培养基地,
浙江 临安 311300 )
摘 要:为了研究核桃EST 序列的通用性以及山核桃的遗传多样性,从NCBI 数据库的核桃EST 序列中设计了
20 对引物,并从中筛选出6 对,对24 份山核桃以及27 份核桃样品进行分析,共检测到46 个位点,其中多态性
N )平均为1.869 6,有效
位点4 1 个。利用Popgen32 软件对6 组引物进行分析。结果表明,观察等位基因数 (a
N H I
等位基因数 (e )平均为1.623 4 ,基因多样性指数 ()平均为0.344 7,Shannon 信息指数 ()平均为0.502 3 。
采用UPGMA 法进行聚类分析,在相似系数为0.73 时所有样品可明显区分为2 个类群,说明由核桃EST 筛选出
的EST-SSR 引物具有较好的通用性,可用于山核桃遗传分析、系统分类以及品种鉴定。
关键词:山核桃;EST-SSR ;遗传多样性
中图分类号:S664.1 文献标志码:A 文章编号:1003—8981(2013)03—0010—06
Screening and universal analysis of EST-SSR primers in Carya cathayensis
1,2 2 1 1
HUANG Shao-yong , ZHANG Zhi-jun , LUO Shu-ping , LI Jiang
(1. Xinj iang Agricultural University, Urumqi 830052, Xinj iang, China; 2. State Key Laboratory Cultivation Base of
Subtropical Silviculture, Zhej iang Agriculture and Forestry University, Lin ’an 311300, Zhej iang, China)
Abstract: In order to study universality of EST sequences and genetic diversity of Carya cathayensis, 20 pairs of
primers were designed from walnut EST sequences in the NCBI database, and then 6 pairs were selected out. 24 pecans
samples and 27 walnut samples we
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