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类群特异性pcr引物设计与评价-生物信息学
11 2 Vol.11No.2
2013 6 ChineseJournalofBioinformatics Jun.,2013
doi:103969/j.issn.1672-5565.2013.02.01
PCR
1,2 1 1 1 1
, , , ,
(1. , 266071;2. , 100049)
: 18SrDNA PCR , Primrose
PCR , PCR
。
: PCR ; ;Primrose;18SrDNA
:Q518.2 :A :1672-5565(2013)-02-079-07
Designandevaluationofgroup-targetedPCRprimers
1,2 1 1 1 1
DONGSheng ,YUZhiming ,SONGXiuxian,HANXiaotian,CAOXihua
(1KeyLaboratoryofMarineEcologyandEnvironmentalSciences,InstituteofOceanology,ChineseAcademyofSciences,
Qingdao266071,China;2UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,China)
Abstract:Wetakethedesignandevaluationofeukaryoticalgaetargeted18SrDNAPCRprimersasanexample,to
giveastepbystepillustrationofhowtodesignandassessgrouptargetedPCRprimersusingPrimroseandother
programs.Thenwesummarizetheadvantagesofthedesign&evaluationpipelinebycomparingtheamplificationef
ficiencyofnewlydesignedandpreviouslyreported18SrDNAuniversalprimers.Cautionsarealsoemphasizedonu
singPCRbasedstrategiestoassesscommunitydiversity.
Keywords:GrouptargetedPrimers;EukaryoticAlgae;Primrose;18SrDNAUniversalPrimers
PCR (GrouptargetedPCR rDNA;
primers
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