肠道细菌乳糖酶基因多样性分析通用引物-应用与环境生物学报.pdfVIP

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2017-11-15 发布于天津
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肠道细菌乳糖酶基因多样性分析通用引物-应用与环境生物学报

2017-08-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2016.10008 / Chin J Appl Environ Biol 2017 23 ( 4 ) : 0758-0763 应用与环境生物学报，肠道细菌乳糖酶基因多样性分析通用引物* 1, 2 1 1 1** 1** 1 龙承星贺璐刘又嘉惠华英谭周进李丹丹 1湖南中医药大学长沙 410208 2湖南人文科技学院数学与金融学院娄底 417000 NCBI [Beta-galactosidase lacZ ] 摘要为深入研究肠道细菌乳糖酶基因多样性，根据公布的细菌乳糖酶基因（）序列，利用软件Primer Premier 5.0前后设计合成7对通用引物，经过PCR扩增、宏基因组测序和生物信息学分析进行引物筛 PCR 436R 375R 217R 406R 436 324 194 选. 扩增电泳中，、、和四对引物没有扩增出目的片段，、和三对引物均有目的条带 436 324 194 324 扩出. 内容物样品扩增，引物条带最清晰，灵敏性高，和引物条带质量相差不大；粘膜样品扩增，引物均 436 194 扩增出目的条带，条带清晰明亮. 引物只扩增出一个样品的目的条带，灵敏度较差；引物扩增杂带多，特异性 194 324 436 98% 差. 样品序列统计方面，删除宿主序列信息后，内容物样品中，、和三对引物最终序列比例均达以上；粘 194 436 324 OTU 324 膜样品中，引物特异性最差，引物最好，引物居中. 聚类和注释方面，内容物样品中，引物扩增物种 436 32