哺乳动物生物钟的数学建模及研究进展-动力学与控制学报.pdfVIP

第１０卷第３期２０１２年９月 动力 学 与控 制 学报 Ｖｏｌ．１０Ｎｏ．３ １６７２６５５３／２０１２／１０ ／２６３５ Ｓｅｐ．２０１２ ⑶ ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＤＹＮＡＭＩＣＳＡＮＤＣＯＮＴＲＯＬ 哺乳动物生物钟的数学建模及研究进展 １ ２ 李莹 　刘曾荣 （１．上海海洋大学信息学院，上海　２０１３０６）（２．上海大学系统生物技术研究所，上海　２００４４４） 摘要　由于数学模型在整合实验数据和分析基因调控网络的动力学方面的独特优势，近年来数学模型在生 物节律研究领域越来越受到人们的重视．哺乳动物昼夜节律是由位于视觉交叉上颌的神经元控制的，其中 的每个神经元都含有一个内在的生物钟，关键的问题是具有广泛周期分布的神经元振子之间如何达到相同 步．在分子水平上结合数学方法中的网络分析与控制的观点构建生物网络，然后用非线性动力学的相关知 识进行理论分析和数值模拟，是研究生命现象的一个有效途径．本文从系统生物学的研究思路，对生物钟的 数学建模及其动力学研究做了一个综述，并对其今后的研究热点进行了展望． 关键词　昼夜节律，　生物钟，　同步，　振子 随着人类基因组计划的完成和分子生物学技 引言 术的不断完善，我们已经掌握了包括果蝇、小鼠等 生物节律（生物钟）广泛存在于大自然的各种 模式生物和人类的所有遗传信息的组成，因此从系 生命活动中，是上亿年内生物在其发生和进化过程 统生物学的思路出发研究生物节律的产生机制已 中，为了与环境变化相适应而逐渐形成的内源性的 成为可能．目前已发现生物体内存在众多的时钟基 与自然环境周期性变化相似的节律性的生命活动． 因和钟控基因，时钟基因的表达调控网络（如转录 从蓝藻到人类，几乎所有生物体的生理、代谢活动 一翻译反馈环路等）在昼夜节律的发生和维持中起 和行为过程都表现出以２４小时为周期的昼夜节律 着关键作用．另一方面，由于数学模型在整合实验 性．人们最熟悉的昼夜节律是每天的睡眠一觉醒节 数据和分析耦合反馈环路组成的基因调控网络的 律．此外，人体的其它生理功能，如体温、激素分泌 动力学方面的独特优势，近年来数学模型在生物节 和血压等也均表现出稳定的昼夜节律性变化．经过 律研究领域越来越受到人们的重视．一个好的数学 长期进化，生物机体内发育分化出一个特殊的器官 模型不仅能帮助我们理解生物钟的复杂结构，而且 一生物钟，用来协调各种不同组织与器官的昼夜节 可以预测新的行为以供实验进一步验证． 律，使生物体适应自然界的环境变化． 本文从系统生物学的研究思路，对生物钟的的 昼夜节律的破坏将导致机体功能紊乱甚至疾 数学建模及其动力学研究做一个综述，并对其今后 病，例如飞行引起的时差反应、睡眠时相延迟综合 的研究热点进行展望． 征、睡眠时相提前综合征、非２４小时睡眠一觉醒模 １　生物钟的生物学机制 式、轮班制工作引起的睡眠障碍和心血管疾病等． 由于生物钟维持节律的分子机制没有研究清楚，目 哺乳动物在生理及行为上表现出来的节律行 前还不能对这些疾病进行有效的治疗．因此，在分 为是由ＳｕｐｒａｃｈｉａｓｍａｔｉｃＮｕｃｌｅｕｓ（ＳＣＮ）中的起搏器 子水平上研究昼夜节律的调控机制，已成为生物学