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巨细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究-上海海洋大学学报
文章编号:1674-5566(2016)03-0337-07 DOI:10.12024/jsou.20150701515
巨 细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究
1,2 1,2 1,2 1,2 1,2
杜 民 ,牛宝珍 ,王婷婷 ,艾加林 ,刘艳红
(1.红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,云南 蒙自 661199;2.红河学院生命科学与技
术学院,云南 蒙自 661199)
摘 要:采用PCR技术克隆得到12尾巨 (Bagariusyarrelli)的细胞色素氧化酶 (CO )、细胞色素氧化酶
Ⅰ Ⅰ
(CO )和细胞色素氧化酶 (CO )的基因序列。结果显示:巨 CO 基因序列全长1551bp,12个个
Ⅱ Ⅱ Ⅲ Ⅲ Ⅰ
体共出现9个单倍型,13个突变位点;CO 基因序列全长691bp,12个个体共出现5个单倍型,5个突变位
Ⅱ
点;CO 基因序列全长784bp,12个个体出现7个单倍型,8个突变位点。通过最小进化法MinimumEvolution
Ⅲ
(ME)构建系统发育树分析显示,巨 与14种 科鱼在序列上有一定的同源性,并且 CO 、CO 和CO 都
Ⅰ Ⅱ Ⅲ
与中华纹胸 (Glyptothoraxsinense)、福建纹胸 (Glyptothoraxfukiensis)、三线纹胸 (Glyptothoraxtrilineatus)
和长丝黑 (Gagatadolichonema)在同一个分支,表明巨 与纹胸 属和黑 属有较近的亲缘关系。
关键词:巨 ;CO ;CO ;CO ;序列分析;系统发育
Ⅰ Ⅱ Ⅲ
中图分类号:S917 文献标志码:A
巨 (Bagariusyarrelli)在中国分布于云南省 氧化酶由13个亚基组成,其中3大亚基(CO 、
Ⅰ
[1] CO 、CO )由线粒体基因(mitochondrialDNA,
境内的澜沧江、怒江、元江水系 ,其肉呈黄色, Ⅱ Ⅲ
[11]
故地 方 名 叫 “黄 鱼”,隶 属 于 硬 骨 鱼 纲 mtDNA)编码合成,具有酶催化活性 ,是线粒体
(Osterichthyes)、鲶形 目(Siluriformes)、 科 内膜上呼吸链的重要组成部分,具有较高的保守
(Sisordae)、 属(Bagarius)。巨 是云南特有的 性,是研究远缘物种系统分类和演化的有效基
[2] [12]
大型底栖食肉鱼类,其体质量可超过50kg 。 因 。目前,学者利用CO 基因、CO 基因、CO
Ⅰ Ⅱ
目前对巨 的研究主要集中在巨 的外部形态 Ⅲ基因对鱼类的遗传变异与系统发育进行了研
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