巨线粒体dnand6基因克隆及多态性分析-江苏农业科学.pdfVIP

— ６２— 江苏农业科学　２０１６年第４４卷第４期 牛宝珍，杜　民，刘艳红，等．巨 线粒体ＤＮＡＮＤ６基因克隆及多态性分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１６，４４（４）：６２－６５． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０１６．０４．０１６ 巨 线粒体 ＤＮＡＮＤ６基因克隆及多态性分析 牛宝珍，杜　民，刘艳红，白　莉，艾家灵 （红河学院生命科学与技术学院／云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室，云南蒙自６６１１９９） 　　摘要：利用ＧｅｎＢａｎｋ数据库中 科鱼线粒体ＮＤ６基因序列保守区设计引物，采用ＰＣＲ技术克隆并测序，共得到 １２尾巨 ＮＤ６基因全序列。用ＤＮＡＭＡＮ５．０软件比对序列，ＭＥＧＡ５．０软件分析 科不同鱼类的进化关系，结果表 明：巨 ＮＤ６基因序列全长为５１６ｂｐ，碱基含量分别为 １４．２０％、３４．５０％、４０．２０％、１１．００％，其中“Ａ＋Ｔ”含量 （５４．４０％）高于“Ｇ＋Ｃ”含量 （４５．５０％），存在４个单倍型，发生３次颠换；１２个个体４个单倍型间的平均相对遗传距 离为０．００３；将巨 与其他１４种鱼类的ＮＤ６基因用Ｎｅｉｇｈｂｏｒｅ－Ｊｏｉｎｉｎｇ（ＮＪ）法构建系统发育树，发现巨 单独聚为１ 支。研究将为今后鱼类线粒体基因组的研究提供科学依据。 　　关键词：巨 ；线粒体；ＮＤ６基因；多态性；系统进化 　　中图分类号：Ｓ９１７．４　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１６）０４－００６２－０４ 　　巨 （ＢａｇａｒｉｕｓｙａｒｒｅｌｌｉＳｙｋｅｓ）是云南省特有鱼类，主要分 因位于Ｌ链上，处于细胞色素ｂ与ＮＤ４之间的连续区域，是线 ［７］ 布于元江、澜沧江、怒江流域，属于鲇形目（Ｓｉｌｕｒｉｆｏｒｍｅ） 科 粒体内膜呼吸链的重要组成成分 。在氢化辅酶中，由于ＮＤ６ （Ｓｉｓｏｒｉｄａｅ） 属 （Ｂａｇａｒｉｕｓ）。巨 个体很大，体质量约 基因序列不易发生变异，进化速度一般，且基因片段不长，因此 ５０ｋｇ，全身无鳞，皮肤表面布满细密的微小颗粒物，使其皮肤 常用来研究物种的遗传多样性、种群之间的亲缘关系以及系统 ［８］ 极为粗糙，此外其体表无黏液，身体背面颜色为灰黄色，腹面 进化关系 。方月琴等用复合扩增体系，选择线粒体ＮＤ６基 ［１］ 为白色，肌肉为黄色，所以又称“黄鱼” 。巨 为底栖肉食 因进行种属鉴定，结果表明，该方法可以将１３种不同的动物区 ［９］ 性鱼类，具有口宽、上下颌都有齿带、牙齿呈锥形且排列紧密、 分开来 。也有研究表明，ＮＤ６基因与人类疾病帕金森氏症 ［１０］ ［１１］ 鳃耙粗短、胃大、肠短等特点，主要食物为鱼类、虾、泥鳅、水生 等发生有关 ，ＮＤ６基因还被用于研究鸟类的亲缘关系 ， ［２］ ［１２－１３］ 昆虫 。田树魁等通过比较巨 、叉尾鲇、斑点叉尾 ３种 但是大多应用于鱼类群体和亚种间的遗传变异研究 。对 鱼肌肉中常规营养成分和氨基酸含量，发现巨 肌肉中蛋白 巨 的线粒体ＮＤ６基因全序列进行检测分析，进而分析巨 质、粗脂肪和必需氨基酸的含量比常规鱼类高，是一种具有较 遗传结构、