武汉耐多药结核分枝杆菌的miru-vntr分子特征-中华疾病控制杂志.pdfVIP

·２６· ＣｈｉｎＪＤｉｓＣｏｎｔｒｏｌＰｒｅｖ　２０１７　Ｊａｎ；２１（１） 武汉市耐多药结核分枝杆菌的ＭＩＲＵＶＮＴＲ分子特征 １ ２ ２ ２ ３ ３ 段琼红 ，陈聪 ，王坚杰 ，周美兰 ，任易 ，陈军 　　【摘要】　目的　描述武汉市耐多药结核分枝杆菌基因型分布及成簇特征。方法　选取 １５个结核分枝杆菌重 复序列（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｌｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅｕｎｉｔ，ＭＩＲＵ），对９８株耐多药结核分枝杆菌进行多位点数目可变串联重 复序列分析（ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｌｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅｕｎｉｔｖａｒｉａｂｌｅｎｕｍｂｅｒｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔｔｙｐｉｎｇ，ＭＩＲＵＶＮＴＲ）分型，计算差 异遗传值、ＨｕｎｔｅｒＧａｓｔｏｎ指数（ＨｕｎｔｅｒＧａｓｔｏｎｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｏｒｙｉｎｄｅｘ，ＨＧＤＩ）、成簇率以及近期感染率最小估计值。结果 　ＭＩＲＵ位点组合的多态性差异遗传值为０９６０４、ＨＧＤＩ为０９７０８，多态性和分辨指数最高的位点为Ｍｔｕｂ２１及 ＭＩＲＵ２６。共产生７个基因簇和６５个独立基因型，成簇率为３３６７％，近期感染率最小估计为２６５３％。结论　１５ 位点ＭＩＲＵＶＮＴＲ分型法分辨指数较高，适合于武汉地区耐多药结核分枝杆菌的基因分型。尽管武汉市耐多药肺 结核病的流行多半归因于内源性复燃，但仍有较高比例的近期传播。 【关键词】　分枝杆菌，结核；广泛耐药结核；基因型 【中图分类号】Ｒ３７８９１１；Ｒ１８１２　　　　 【文献标识码】Ａ　　 【文章编号】１６７４３６７９（２０１７）０１００２６０４ ＤＯＩ：１０．１６４６２／ｊ．ｃｎｋｉ．ｚｈｊｂｋｚ．２０１７．０１．００６ ＡｎａｌｙｓｉｓｏｎｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｍｕｌｔｉｄｒｕｇｒｅｓｉｓｔａｎｔｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓｉｎＷｕｈａｎｗｉｔｈＭＩＲＵＶＮＴＲｍｅｔｈｏｄ　ＤＵＡＮ １ ２ ２ ２ ３ ３ Ｑｉｏｎｇｈｏｎｇ，ＣＨＥＮＣｏｎｇ，ＷａｎｇＪｉａｎｊｉｅ，ＺＨＯＵＭｅｉｌａｎ，ＲＥＮＹｉ，ＣＨＥＮＪｕｎ．　１．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＴｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ Ｃｏｎｔｒｏｌ，ＷｕｈａｎＩｎｓｔｉｔｕｔｅｆｏｒＴｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓＣｏｎｔｒｏｌ，Ｗｕｈａｎ　４３００３０，Ｃｈｉｎａ；２．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＴｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓＣｏｎｔｒｏｌｆｏｒ ＱｉａｏｋｏｕＤｉｓｔｒｉｃｔ，ＷｕｈａｎＩｎｓｔｉｔｕｔｅｆｏｒＴｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓＣｏｎｔｒｏｌ，Ｗｕｈａｎ　４３００３０，Ｃｈｉｎａ；３．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｌｉｎｉｃａｌＬａｂｏｒａｔｏｒｙ， ＷｕｈａｎＩｎｓｔｉｔｕｔｅｆｏｒＴｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓＣｏｎｔｒｏｌ，Ｗｕｈａｎ　４３００３０，Ｃｈｉｎａ 　　【Ａｂｓｔｒａｃｔ】　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　Ｔｏｄｅｔｅｒｍｉｎｅｔｈｅｇｅｎｏｔｙｐｅａｎｄｃｌｕｓｔｅｒｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｍｕｌｔｉｄｒｕｇｒｅｓｉｓｔａｎｔ（ＭＤＲ）ｍｙｃｏ ｂａｃｔｅｒｉｕｍｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓｉｎＷｕｈａｎＣｉｔｙ．Ｍｅｈｔｏｄｓ　９８ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓｉｓｏｌａｔｅｓｆｒｏｍＭＤＲｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ（ＭＤＲ ＴＢ）ｐａｔｉｅｎｔｓｗｅｒｅｇｅｎｏｔｙｐｅｄｂｙｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｌｉｎｔｅｒｓｐｅｒｓｅｄｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅｕｎｉｔ ｖａｒｉａｂｌｅｎｕｍｂｅｒｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔｔｙｐｉｎｇ（ＭＩＲＵ ＶＮＴＲ）．Ａｌｌｅｌｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＨｕｎｔｅｒＧａｓｔｏｎｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｏｒｙｉｎｄｅｘ（ＨＧＤＩ），ｃｕｍｕｌａｔｉｖｅｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇｒａｔｅａｎｄｍｉｎｉｍｕｍｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｒａｔ