草鱼载脂蛋白ai-1基因3蒺非编码区snps筛选及其与-大连海洋大学.pdfVIP

第27卷第1期 大 连 海 洋 大 学 学 报 Vol.27 No.1 20 12 年2 月 JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITY Feb . 2012 文章编号:2095-1388(2012)01-0012-06 草鱼载脂蛋白A-I-1基因3蒺非编码区SNPs 筛选及其与生长性状的关联分析 1、2 2 2 2 刘小献 , 白俊杰 , 于凌云 , 李胜杰 摇 摇 摇 (1. 大连海洋大学 水产与生命学院, 辽宁 大连 116023;2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所, 农业部热带亚热带 水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380) 摘要:采用PCR产物直接测序法和PCR-RFLP法对草鱼EST文库中载脂蛋白A-I-1基因 (Apoprotein A-I -1, apoA-I-1) 3蒺非编码区进行SNPs筛选, 在珠江水系草鱼 Ctenopharyngodon idella养殖群体 144 个样本 中发现2个SNPs位点。 C792T位点的CC型占46郾53%, CT型占50郾69%, TT型占2郾78%; G851A位点的 GG型占77郾08%, GA型占20郾83%, AA型占2郾08%。 采用一般线性模型对2个SNPs位点与草鱼4个生长 性状———体质量、 体长、 体高和头长进行关联分析, 结果表明: C792T位点TT型个体的体质量、 体长、 体 高和头长均值高于CT型和CC型个体的生长性状指标值, 但未达到显著水平 (P0郾05); G851A位点GG 型个体的体质量、 体长、 体高和头长均值高于GA型和AA型个体的生长性状指标值, 且GG型个体的体长 和头长均值与GA型和AA型个体均存在显著差异 (P0郾05)。 将2个 SNPs位点不同基因型组合成6种双 倍型, 关联分析结果表明, 双倍型 D3 (TT -GG ) 个体的体质量均值最高, D6 型 (CC - C792T G851A C792T AA ) 个体的体质量均值最低, 且二者在体长、 体高、 头长均值间存在显著差异 (P0郾05)。 推测 G851A C792T位点TT型为有利基因型; G851A位点GG型为有利基因型, AA型为不利基因型。 本研究结果为草 鱼分子辅助育种提供了候选标记, 为加快草鱼育种进程奠定了基础。 关键词:草鱼; SNP; 载脂蛋白A-I; apoA-I-1; 生长性状; 双倍型; 关联分析 中图分类号: Q789摇 摇 摇 摇 文献标志码: A [2] 摇 摇 草鱼 Ctenopharyngodon idella 隶属于鲤形 目、 过程中具有重要作用 , 对鱼类生长存在潜在的 鲤科、 雅罗鱼亚科、 草鱼属, 是中国淡水养殖四大 作用。 一些学者在对鲤、 虹鳟和斑点叉尾鮰的研究 家鱼之一, 有着重要的经济价值。 由于草鱼亲鱼的 中发现, apoA-I还存在潜在的抗菌活性, 具有部 个体大、 性成熟周期长, 给其良种选育带来了困 分免疫功能, 对鱼类的健康生长具有一定的保护作 [2-4] 难, 目前尚未获得遗传改良的品种或品系。 利用 用 。 本试验中, 作者采用PCR产物直接测序法 DNA遗传标记进行辅助选育