南美白对虾肠道微生物群落的分子分析-core.pdfVIP

47 卷 　4 期 ( ) 微 生 物 学 报 47 4 : 649～653 2007 年 8 月 4 日 Acta Microbiologica Sinica 4 August 2007 南美白对虾肠道微生物群落的分子分析 1 1 ,2 1 3 李 　可 ,郑天凌 , 田　蕴 ,袁建军 ( 1 2 ) 厦门大学 生命科学学院环境微生物研究所 　 近海海洋环境科学国家重点实验室 　厦门　361005 (3 泉州师范学院生物学系 　泉州 　362000) 摘 　要 : 采用分子生物学手段 16S rDNA 克隆文库方法对实验室养殖条件下的南美白对虾肠道细菌进行了多样性 ( ) 研究 。用限制性片段长度多态性 RFLP 方法从文库中筛选出可能不同细菌来源的克隆子 12 个 ,测定其 16S rDNA 片段核甘酸序列 ,将所获得的序列与 GenBank 数据库进行BLAST 比对 ,结果表明:南美白对虾肠道的 16S rDNA 克隆 ( ) ( ) 文库中 126 个克隆子分属 2 个不同的细菌类群 :变形细菌 Proteobacteria 和厚壁细菌 Firmicutes ,其中厚壁细菌为优 势菌群占到 754 % ,且与最相似序列同源性均低于 94 % ;变形细菌占到 246 % ,与最相似序列同源性均高于 98 % , ( ) ( ) ( ) ( ) 分别为希瓦氏菌属 S hewanella ,泛菌属 Pantoea ,A ranicola 属 ,假单胞菌属 Pseudomonas 和弧菌属 Vibrio 。 关键词 : 南美白对虾 ;肠道 ;细菌多样性 中图分类号 :Q939 　　文献标识码 :A 　　文章编号 (2007) 　　随着现代集约化和规模化水产养殖业的发展 , 1 　材料和方法 应激原增多 ,导致水产动物免疫抗病力下降 ,其对疾 病的易感性大大增强 。人们通常采用抗生素 、化学 11 　材料 合成药物等防治水产动物疾病 ,但长期 、大量使用抗 111 　南美白对虾肠道样品:健康养殖南美白对虾 生素的负面效应 日益明显地暴露出来了:不仅破坏 ( ) 样品 5～6g只 于 2006 年 2 月随机采于福建省厦门 水产动物肠道正常菌群组成 ,造成肠道内微生态失 (