土壤宏蛋白质组学在土壤污染评价中的应用-应用生态学报.pdfVIP

应 用 生 态 学 报摇 2012年10月摇 第23卷摇 第10期摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 ChineseJournal of Applied Ecology,Oct. 2012,23(10):2923-2930 土壤宏蛋白质组学在土壤污染评价中的应用* 1,2 1,2** 1,2 2 张摇 曦 摇 李摇 锋 摇 刘婷婷 摇 陈英旭 1 2 ( 浙江大学环境与资源学院环境保护研究所,杭州310058; 浙江大学水环境研究院,杭州310058) 摘摇 要摇 土壤微生物指标是评价土壤污染程度的重要生物学指标之一.近年来,随着分子生 物学的发展,应用宏基因组学、宏转录组学和宏蛋白质组学技术考察土壤微生物的生态功能 成为土壤功能的研究热点.相对于宏基因组学和宏转录组学,土壤宏蛋白质组学是以土壤微 生物基因的功能组分———蛋白质为直接研究对象,考察不同时空点提取出来的土壤蛋白质的 变化规律,更有助于揭示土壤微生物的生态功能及其在污染物迁移转化过程中的作用,在评 价土壤污染方面也更具潜力. 目前,土壤宏蛋白质组学正处于起步阶段,而土壤蛋白质的提取 方法是制约其发展的主要因素之一,因此本文综述了蛋白质作为土壤污染评价指标的优势, 重点比较了不同土壤蛋白质提取方法的优劣,结合案例分析了蛋白质作为土壤污染评价指标 的可行性及存在的问题,并对土壤宏蛋白质组学的发展进行展望. 关键词摇 土壤污染摇 土壤微生物摇 宏蛋白质组学摇 土壤蛋白质提取方法 文章编号摇 1001-9332(2012)10-2923-08摇 中图分类号摇 X53摇 文献标识码摇 A 1,2 Applications of soil metaproteomics in soil pollution assessment:A review. ZHANGXi ,LI 1,2 1,2 2 1 Feng ,LIU Ting鄄ting ,CHEN Ying鄄xu ( Institute of Environmental Science and Technology, College of Environmental and Resource Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058, China; 2Academy of WaterScienceandEnvironmentalEngineering,Zhejiang University,Hangzhou310058, China).鄄Chin.J.Appl.Ecol. ,2012,23(10):2923-2930. Abstract:Soil microbial indicator isone of the important biological indicatorsin evaluating the ex鄄 tent of soilcontamination. Inrecentyears,withthedevelopmentofmolecularbiology,many studies have focused on the ecological functions of soil microorganisms by using metagenomics,metatran鄄