微生物群落是否在适应性免疫的完善中扮演了重要角色.docVIP

微生物群落是否在适应性免疫的完善中扮演了重要角色？ 前言: 虽然微生物一直被当作病原体看待，但现在已证实：大多数寄主与细菌之间是共生关系。随着宿主机体的成熟，肠道细菌塑造了胃肠道免疫系统中的组织、细胞，以及分子结构。这种伙伴关系经过数百万年协同进化而形成。它基于一种信号分子的交换：细菌的信号分子被宿主的受体识别，最终产生了对微生物体及人类都有益的结果。我们探索了肠道内共生细菌是如何影响适应性免疫的某些特定方面的问题。了解了调节共生细菌与人类之间共生关系的分子机制可能会重新定义我们对获得性免疫的完善与进化的认识，并会因此改善我们治疗众多免疫失调症的方法。 正文: 我们很幸运，我们并不孤单。因为人类为数量庞杂、物种繁多的微生物群体提供了生存空间。虽然目的论者会预测免疫系统注定会逐步演化以消除传染性的微生物，不过，我们现在知道几乎我们身体上每一处与外界环境相接触的表面都充斥着共生细菌。这些微生物群落深深地影响了它们所居住的组织在结构功能上的构建，因此，它们在调节健康与疾病的平衡的工作中扮演了极其重要的角色。当我们从进化的角度看时，“共生细菌是影响组织与细胞的发育的关键因素”的这一理念是十分合理的。 早在第一个真核细胞出现之前，细菌就已经统治地球20亿年了，它们几乎占据了地球上每一片陆地，每一片海洋。真核细胞中的线粒体与叶绿体就是从细菌继承下来的，这表明细菌在高级生物体的进化过程中起到了很重要的作用。当多细胞后生生物演化出更复杂的身体结构后，细菌得到了可在生物体内生存的本领。动物为微生物的繁衍提供了一个稳定、营养丰富的生态系统，因此，宿主的健康对微生物来说最重要。这样，宿主从多样的共生微生物中获益，它们可以帮助宿主消化复杂的碳水化合物，提供基本的营养物质给哺乳动物。 然而，共生微生物可不是宿主唯一遇到的东西。宿主免疫系统面临的一个最大挑战是区分有益微生物与致病微生物，因为它们拥有相似的可被先天性免疫识别的分子结构（如：脂多糖、肽聚糖、脂蛋白、鞭毛）。分辨特定的微生物可以算是获得性免疫的一个功能，它可以分辨离散分子序列并根据抗原的性质进行亲炎症或消炎性的应答。尤其是CD4+T细胞，它有极强的可塑性，在胸腺发育后分化为不同种类，这样，它能够感知环境中由微生物释放的物质。在脊椎动物中，这种感知不同微生物并对其产生应答的能力很可能是被细菌自身的进化的动力牵引向前的，最终令免疫系统不仅仅是简单地清除病原体（理论上，它们也可以通过改善宿主健康帮助微生物群）。最近的证据显示共生微生物控制了T细胞分化的大部分程序，以此提高了宿主基因组的表达，进而令免疫系统发挥其全部功能。 这篇文章中，我们对由悉生生物学派生出的概念进行了综述，以揭示共生细菌是如何完善适应性免疫的功能的。我们尤其研究了CD4+T辅助细胞如何在胃肠道内分化，免疫系统如何被微生物体塑造成型。在此基础上，我们对肠道共生菌如何演化到可以深深影响免疫系统健全的地步，以及其原因进行了推论。理解了人类与微生物的协同进化，微生物世界很可能被重新定义。我们也能利用人体内共生细菌的免疫属性为治疗自身免疫性疾病与炎症方面提供帮助。 微生物体是如何塑造并完善宿主免疫功能的 虽然微生物群落居住于生物体中:包括皮肤表面、阴道中、嘴里，但在下消化道中居住了密度极大、种类极多的共生微生物，包括细菌、古细菌、原生生物、菌类，有时也有多细胞寄生虫。不过，只有细菌占主导地位，在宿主中数目达到了100万亿。最近对微生物群中的细菌基因组序列的测定逐渐揭示了细菌的遗传特征，并表明我们的共生微生物中含有比人类多150倍的非冗余基因。几十年来，在实验室中养殖微生物的技术仅限于鉴定可人工养殖的微生物，而这些微生物仅代表了肠道中微生物的很小一部分。人类身体中的所有共生微生物总和大约有1000到1150个物种，而每个人身体中大约有160个物种。这表明个体中的微生物组成是有区别的，而且是可以适应外界环境和宿主基因的。 在无菌环境下生长的动物为微生物对宿主免疫系统的影响提供了重要依据。肠相关淋巴组织（GALT）,是肠粘膜中的第一道防御线，但是，在无菌环境下生长的小鼠的GALT的发育是有缺陷的。小鼠的体内的肠系膜淋巴结、小肠固有层、派氏斑（Peyer’s patches）减少、萎缩，而它们与动物和微生物的共生有关。除了组织形成上的缺陷外，肠免疫系统分子与细胞层面上的架构也因没有共生细菌而瓦解了。在这些小鼠体内，作为隔开体腔、免疫系统与肠道的物理屏障，肠上皮细胞中对Toll样受体与MHCⅡ复合体的表达下降了。而这两种分子的作用分别是感知病原体与呈递抗原。上皮内淋巴细胞（IELS）是一类在上皮穿插的特殊的T细胞。而在无菌环境内生长的小鼠体内，IELs的数量减少，它们产生的细胞毒素也分解