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肌红蛋白只有一个氧结合位置
p.181 圖5-23 圖 5-23 由免疫球蛋白單元所構成的 IgM 五聚體。此五聚體結構以雙硫鍵(黃色)連結而成,其中 J 鏈是一個分子量 20,000 的多肽鏈,存在於 IgA 與 IgM 中。 IgG 是次級免疫反應中主要的抗體。 IgE 在過敏反應中扮演重要的角色,作用的對象為血液中的嗜鹼細胞(basophils,另一種吞噬性白血球)以及廣泛分布於組織中能分泌組織胺的肥大細胞。 p.181 p.181 圖 5-24 圖 5-24 由免疫球蛋白單元所構成的 IgM 五聚體。抗體的 Fc 部分與巨噬細胞表面的 Fc 受體結合後,會誘發巨噬細胞吞噬並摧毀該病毒。 p.181 抗體緊密且專一地與抗原結合 抗原與抗原結合部位之間的化學互補性;影響互補性的因素有結合位的形狀和帶電分子、非極性分子及氫鍵形成的官能基的分布位置。 p.182 圖 5-25 p.182 圖 5-25 抗原與 IgG 結合時所發生的誘導配合。此處為 IgG 的 Fab 片段之表面輪廓,而與 IgG 結合的抗原是 HIV 上的一小段胜肽。重鏈(藍色)上的兩個殘基與輕鏈(粉紅色)上的一個殘基作為圖示的參考點。(a) Fab 片段中的抗原結合部位俯視圖(PDB ID 1GGC)。(b) 與抗原「結合」後,抗原結合位置發生了構形上的改變(PDB ID 1GGI)(此圖沒有顯示出抗原分子),結合凹槽擴張以容納抗原,且部分的官能基也發生移動的情形。(c) 與 (b) 圖相同,但以桿狀結構標示出紅色的抗原分子。 圖 5-25 (續) p.182 抗體-抗原交互作用是許多重要分析方法的基礎 一般使用的抗體製備成品可分成兩種:多株抗體和單株抗體。 多株抗體(polyclonal antibodies)是由許多不同的 B 淋巴球針對同一個抗原所產生的抗體。 單株抗體(monoclonal antibodies)則是由同一種族群的 B 細胞〔純系(clone)〕所分泌出的抗體。 圖 5-9 (b) p.168 圖5-9 穩定去氧血紅蛋白 T 狀態的一些離子對。 (b) 以展開的血紅蛋白多肽鏈顯示這些離子及其他未出現在圖 (a) 的離子對之間的交互作用。 圖 5-10 p.168 血紅蛋白與氧的協同性結合 在肺部血紅蛋白必須有效地與氧結合(肺內氧分壓 pO2 約 13.3 kPa),並且在組織中釋放氧氣(組織氧分壓 pO2 約 4 kPa)。 肌紅蛋白或其他與氧結合為雙曲線圖形的蛋白質並不適合提供這種功能,原因圖解於圖 5-12。 血紅蛋白能克服上述的問題,是因為當更多的氧分子結合上血紅蛋白時,它便會由低親和狀態(T 狀態)轉換成高親和狀態(R 狀態)。 p.167 圖 5-12 p.169 圖 5-12 S 型(協同性)結合曲線。S 型結合曲線可視為由低親和性轉換到高親和性狀態的混和型曲線。如 S 型曲線表示,具協同性的結合使血紅蛋白能敏銳地偵測到組織與肺部氧濃度的些微差異,而使得血紅蛋白在肺部(高 pO2)與氧結合,並且在組織中(低 pO2)釋放出氧分子。 一個配位基結合到其中一個位置會影響同一個蛋白質上其他結合位置的結合特性時,此蛋白質稱為異位調節蛋白質(allosteric protein) 。 當其配位基與調節因子完全相同時,此時的交互作用稱為同促型(homotropic)交互作用 當調節因子與正常的配位基不同時,則稱為異促型(heterotropic)交互作用。 協同性構形變化取決於蛋白質不同部位的結構穩定性之差異。 p.169 圖 5-13 p.170 圖5-13 與配位基協同性結合時,多次單元蛋白質產生結構變化。蛋白質每個部位的結構穩定性並非全然一致,圖中為一個假設性的二聚體蛋白質,具有高(藍色)、中(綠色)和低(紅色)穩定區域。配位基結合部位是由高和低穩定的兩種片段所組成,因此對於配位基的親和力相對偏低。配位基的結合會導致蛋白質的構形改變,而使得蛋白質從低親和狀態轉變為高親和狀態,此為一種誘導配合現象。 血紅蛋白也運送氫離子和二氧化碳 在粒線體中,有機物氧化產生二氧化碳,這些二氧化碳會水合形成重碳酸鹽 此反應由大量存在於紅血球中的碳酸酐酶(carbonic anhydrase)所催化。 這種 pH 值與二氧化碳濃度對血紅蛋白與氧結合及釋出氧的影響稱為波耳效應(Bohr effect). p.173 血紅蛋白和一分子氧的結合反應可藉由下列結合方程式表示: 其中 β 次單元上的 His146(His HC3)是造成波耳效應的主要來源。 二氧化碳也能與血紅蛋白結合,而且也是與氧的結合呈逆相關。 p.174 FIGURE 5-16 p.174 圖 5-16 圖 5-16 pH 值對血紅蛋白
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