甜菜全基因组信息研究进展 progress on genome-wide information of sugar beet.pdfVIP

No．2 2014年第2期 中 国 甜菜糖业 2014 20l4年6月 cHlNABEET＆SUGAR Jun．2014 文章编号：1002—0551(2014)02—0028—08 甜菜全基因组信息研究进展 李俊良1”，梁乃国2，刘天骄2，龚攀1’2，程大友2，崔杰2+ (1．哈尔滨工业大学生命科学与技术学院，哈尔滨150000； 2．哈尔滨工业大学食品科学与工程学院，哈尔滨150090) 摘要：本文简要介绍了甜菜染色体组的遗传图谱与物理图谱信息，重点阐述了甜菜全基因组测序结果以 及在此基础上的功能基因组学、比较基因组学和不同基因型甜菜的种间差异上最新研究进展，对基因组研 究成果在甜菜育种改良上应用做了简要介绍，并对其前景进行了展望。 关键词：甜菜；基因组测序；功能基因组；比较基因组；种间差异 中图分类号：S566．3 文献标识码：B 谱相对较短，图谱长度对应每个四分体大约1．4交 O前言 换，但其对基因定位及物理图谱的构建工作具有重 要的意义。 自罗马时代起叶用甜菜就被广泛种植，十八世 2012年JuliaIleC．Dohm等心1绘制了甜菜基因 纪晚期人们从食用甜菜和饲用甜菜杂交获得了能 组高密度的密集型连锁图谱，并在BAC克隆体系 在块根中积累大量糖份的糖用甜菜。如今世界上 中以基因为基础绘制了高分辨率的甜菜物理图谱。 糖产量的30％来源于甜菜，同时它也是生产生物 该图谱中包括535个染色体固定重叠区，含有 乙醇、天然色素及动物饲料的重要来源。2000年 以来，随着分子生物学技术的突破性发展，甜菜染 分析两个图谱，图谱中含有的670个特殊位点其平 色体组的遗传图谱、物理图谱及全基因组测序工作 均距离是1．32cM，61％特异的标记对之间的距离 逐步展开，以此为基础我们可以找出影响甜菜农艺 ≤lcM。物理图谱是对遗传图谱的进一步深化，使 学性状的相关基因，这必将极大地促进甜菜分子育 其更加完整且能更加精细准确的定位目的基因及 种工作的发展，同时也能最大化的挖掘出甜菜在能 测序得到的序列信息。 源生物等领域中的潜能。 2甜菜全基因组测序与解析 1 甜菜的遗传图谱与物理图谱 2013年，德国马普分子遗传学研究院、德国基 3利用来自不同父 因调控研究中心、西班牙庞培法布拉大学等机构共 早在1995年C．Hallden等‘1 本的2个砣代群体建立了首个甜菜高密度RFLP同完成了甜菜基因组全序列测定工作旧J。为了给 图谱，包含了413个标记，覆盖了甜菜9条染色体比较植物基因组学及分子育种工作提供一个数据 基础和支持，科研人员选取了二倍体甜菜品系 621cM，标记之间的平均距离为1．5cM。虽然该图 KwS2320作为参考基因型，提取其根系和叶片基 收稿日期：2014—05—30 基金项目：国家自然基金、国家现代农业产业技术体 J。 平台对其进行全基因组测序B’4’5 系专项资金(cARs、科技部技术开发研究专项