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土壤微生物群落磷脂脂肪酸(PLFAs)生物标记多样性分析
张秋芳1,刘 波1**,林营志1,唐莉娜2,史 怀1,杨述省1,周先冶1
(1福建省农科院农业生物资源研究所,福建 福州 350003;
2福建省烟草公司,福建 福州350003)
摘要:以磷脂脂肪酸(PLFAs)作为生物标记是一种可定性和定量地分析土壤微生物群落多样性的方法。本研究应用生态学评价方法,即结合Shannon-Wiener(H1)?Brillouin(H2)? Mcintosh(H3)多样性指数?丰富度指数(S)和Pielou均匀度(J)?Simpson优势度指数(D)等各多样性指数测度方法,以烟草土壤为例,分析土壤中微生物PLFAs生物标记的多样性?丰富度和均匀度。研究结果表明:不同生长阶段供试烤烟土壤微生物群落中,先后出现了43种PLFAs,PLFAs的生物量于生长后期为最高;各PLFAs的各多样性指数?丰富度和均匀度皆不相同。根据各PLFAs生物标记的含量大小,经聚类分析后得出,可以将其依次分成五大类:Ⅰ类为高含量、高频次和多样性,PLFAs为18:1ω9c的真菌第II类含量I类,多样性指数PLFAs为16:0的假单胞菌标记第III类高含量多样性中等PLFAs为16:1ω5c甲烷氧化菌生物标记第IV类中等含量,多样性中等15:0、a15:0、i16:0和a17:0的PLFA,还有表征厌氧细菌的18:1ω7c以及硫酸盐还原细菌的16:0 10Me;第V类:低含量,低频次和多样性 15:0 3OH、15:1 i G、a16:0、i16:1 G、i16:1 H、17:0、i17:0、15:0 2OH、15:0 3OH、17:0和17:0 2OH的PLFA,存在有表征真菌的18:3ω6c (6,9,12)、放线菌的17:0 10Me和18:0 10Me以及表征原生动物的20:4ω6,9,12,15c。
关键词:土壤;微生物群落;磷脂脂肪酸(PLFAs);生物标记;多样性
The diversity of phospholipid fatty acids biomarker for the microbial community in soils
ZHANG Qiu-fang 1, LIU Bo 1*, LIN Ying-zhi1,
TANG Li-na 2, SHI Huai1, YANG Shu-sheng1 and ZHOU Xian-zi1
(1 Agricultural Bioresource Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou,Fujian 350003,China ;
2 Fujian Tobacco Company,Fuzhou,Fujian 350003 China)
Abstract:Phospholipid fatty acids to detected the microbial community diversity qualitatively and quantitatively. The diversity of phospholipid fatty acids in the tobacco soils was analyzed, firstly combining with the evaluation methods of ecology , such as Shannon-Wiener(H1),Brillouin(H2) and Mcintosh(H3) diversity index,the abundance(S),Pielou evenness(J)and Simpson index(D).he total 43 kinds of PFLAs in the soils which were tested in the different growing periods of tobacco, the biological amount of PLFAs were the highest in the last growing period in 90 days, and the values of diversity, abundance and evenness for biomarkers were changeble in the tobacco fields, that implied the microbial community fluctuated. The 43 kinds of PFLAs biomarkers could be divided into 5 groups as follows: NO.1 was 1
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