形态学标记-生物探索.PPT

鸡是种常见的家禽，长期受到进化生物学家的青睐。它的基因序列也有助于科学家了解农业和进化学上重要特性的遗传学基础。 鸡的进化研究 转基因小鸡 对鸡和人类的基因组进行比较后发现约七千万个碱基对是共有的。 这暗示着在大约三亿一千万年前二个物种从共同祖先分化出来的时候，遗传物质具有守恒性。 鸡和所有的哺乳动物多起源于恐龙 鸟类的祖先——始祖鸟 “分道扬镳” 在鸟类和哺乳动物分离的时候，鸡获得了生成羽毛和喙的蛋白质的基因，而哺乳动物获得了毛皮蛋白质的基因，丧失了与蛋清和蛋黄有关的基因。 鸡的基因组比哺乳动物的紧凑的多，它拥有20万到23万个基因，但仅有十亿个DNA碱基，而同样多的基因人类需要三十亿个碱基。鸡的基因数量与哺乳动物的相当，但它的基因组含有重复的“垃圾”DNA的数量很少。 我国科学家在鸡基因组学研究上的重大突破 中国科学院北京基因组研究所在国际合作的框架下参与和主持完成的原鸡基因组和家鸡基因组多态性研究并于2004年12月9日发表在《自然》杂志上以主题科学论文的形式发表。 《Science》发表论文?我国家蚕基因组研究获国际认可 2004年12月10日 西南农业大学家蚕基因组研究群体的研究论文《家蚕基因组框架图》，于12月10日在国际顶尖科研杂志《Science》上发表，这标志着重庆市家蚕基因组研究成果已得到国际学术界的认可。 丝腺是合成茧丝蛋白质的生物器官，是蚕丝产业的生物学基础。 科学家通过分析家蚕基因组和基因表达谱，发现了1874个家蚕丝腺特异基因，其中97％为新发现；发现了丝腺中激素活动的证据； 科学家甚至比较了家蚕与被称为“生物钢”的蜘蛛丝的生产者——蜘蛛的基因构成，发现了它们共同拥有的１０７个基因。 这些功能基因的获得和功能分析的深入开展，将彻底突破茧丝蛋白质合成相关基因克隆和研究的瓶颈。 而随着家蚕丝腺特异基因研究的深入，中国将很快在改造丝蛋白质结构，克服丝绸天然加工弱点等重要产业技术的研发方面取得突破。 二、基因组学分类 1、根据研究对象分： 　　动物基因组学、植物基因组学、肿瘤基因组学、药物基因组学、环境基因组学等。 2、 根据研究的重点分： 　　结构基因组学、功能基因组学、比较基因组学 三、结构基因组学 （一） 概念和目的 （二） 基因图谱 （三） 结构基因组学研究常用方法 （一）概念和目的 以全基因组测序为目标的基因结构研究弄清基因组中全部基因的位置和结构，为基因功能的研究奠定基础。 其目的是建立高分辨的遗传图谱、物理图谱、转录图谱和序列图谱。 （二） 基因图谱 1. 遗传图谱（连锁图谱） 2. 物理图谱 3. 转录图谱（表达图谱） 4. 序列图谱（分子水平的物理图谱） 1. 遗传图谱（连锁图谱） 概念：指基因或分子标记在染色体上的相对位置与遗传距离，用厘摩（cM）表示。 1cM的遗传距离表示在100个配子中有1个重组子。在哺乳动物中，遗传图谱上1cM的距离大约相当于物理图谱上1 000 000bp。 通过该图谱可分清各基因或分子标记之间的相对距离与方向，如靠近着丝粒或端粒。 该图谱的构建是以位于同一染色体相邻的2个基因或遗传标记的重组率为基因，因而需要有参考家系和分子遗传标记或基因作为研究基础。 2. 物理图谱 指DNA序列上两点间的实际距离。 用于确定各遗传标记间的物理距离有两种物理图谱： （1）以已定位的DNA序列标记位点（STS）为位标，以DNA实际长度为图谱距离的基因组图谱。 （2）由YAC和/或细菌人工染色体（BAC）连续克隆重叠群组成的物理图谱。 3. 转录图谱（表达图谱） 以EST为位标，根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱，它是染色体DNA某一区域内所有可转录序列的分布图，是基因图的雏形。 方法：用已在染色体定位的YAC DNA或BAC DNA为探针，与所有可能相关的各组织cDNA文库杂交，寻找其同源克隆并做进一步分析。 4. 序列图谱（分子水平的物理图谱） 以某一染色体上所含的全部碱基顺序绘制的图谱。 既包括可转录序列，也包括非转录序列，是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和。 （三）结构基因组学研究常用方法 1. 脉冲场凝胶电泳（PFGE） 2. 毛细管电泳 3. 基因芯片技术 4. 全基因组随机测序 四、功能基因组学 1. 概念： 利用结构基因组学提供的信息，以高通量，大规模实验方法及统计与计算机分析为特征，全面系统地分析全部基因的功能。 研究角度包括：生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。 2.功能基因组学常用方法和技术 ⑴ RNA干扰技术（RNAi） ⑵蛋白质组学研究 ⑶生物信息学研究 等。 RNA干扰技术（RNAi） 将一段dsRNA导入机体或细胞后，与它有同源序列的基因的表达被干扰或抑制的现象。dsRNA依赖的转录后基因沉默。1998，Fire，线虫 作用机制 A. Di