赤桉ACT1和ACT2基因的克隆与生物信息学分析-热带亚热带植物学报.PDFVIP

热带亚热带植物学报　2014 ，22(3) ：242 ~ 249 Journal of Tropical and Subtropical Botany 赤桉ACT1 和ACT2 基因的克隆与生物信息学分析 1 2 1 1* 陈鸿鹏, 朱凤云, 吴志华, 谢耀坚 (1. 国家林业局桉树研究开发中心， 广东 湛江 524022； 2. 黄淮学院生物工程系， 河南 驻马店 463000) 摘要： 为了解赤桉(Eucalyptus camaldulensis)肌动蛋 白(Actin)在生长发育过程 中的功能 ，根据赤桉幼苗转录组数据库 中的肌动 蛋 白基 因序列 ，从赤桉嫩 叶中克 隆了 2 条 Actin 基 因片段 ，并利用 RACE 技术获得 Actin 基 因的全长 cDNA ，分别命名为 EC- 和 - 基 因。生物信息学分析表 明，这两条基 因的全长 cDNA 分别为 1533 bp 和 1387 bp ，均含有 1 个编码 377 个 ACT1 EC ACT2 氨基酸的开放阅读框 。经 比对分析 ，赤桉 Actin 蛋 白的氨基酸序列与其他植物 Actin 蛋 白的具有较高的相似性 ，并且具有 Actin 蛋 白特有 的保守序列和相关特征 。因此推测这两条基 因对桉树 的生长发育具有一定 的调控作用 。 关键词： 赤桉 ； 基 因；克隆 ；生物信息学分析 Actin doi: 10.3969/j .issn.1005–3395.2014.03.005 Cloning and Bioinformatics Analysis of ACT1 and ACT2 Genes from Eucalyptus camaldulensis 1 2 1 1* CHEN Hong-peng , ZHU Feng-yun , WU Zhi-hua , XIE Yao-jian (1. China Eucalypt Research Center, Zhanjiang 524022, China; 2. Department of Biological Engineering, Huanghuai University, Zhumadian 463000, China) Abstract: In order to reveal the biological function of Actin in growth and development of Eucalyptus camaldulensis, two fragments were cloned from the transcriptome database of E. camaldulensis seedlings at different developmental stages, named as - and - , and their full-length cDNA were obtained by RACE method. Bioin- EC ACT1 EC ACT2 formatics analysis showed that the full-length cDNA of - and - were 1533 bp and 1387 bp, EC ACT1 EC ACT2 respectively, and both with 1131 bp ORF encoding 377 amino acids. The amino acid sequence of Actin in E. camaldulensis had high similarity to those of other plants with typical conserved domains of Actin. Therefore, the - and - genes might play a role in regulating