转录调控多组学在农学中的应用.pptxVIP

转录调控多组学在农学中的应用 ——表观组学和全转录组的结合;;;转录层面 DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录因子调控等;表观遗传;CH3;; 近年来，大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育等，起着至关重要的作用。;RNA：是以DNA的一条链为模板，以碱基互补配对原则，转录而形成的一条单链，主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达，是遗传信息传递过程中的桥梁。;? RNA的作用及调控机制;2 | lncRNA;2 | lncRNA;2 | lncRNA;3 | miRNA;4 | circRNA;4 | circRNA;全转录组;RNA seq常规分析思路;;1. 全基因组甲基化原理介绍;2. 样品制备及检测;3. 建库流程;;5. 部分结果展示;差异甲基化比较分析——DMR;DMP：TSS上游2kb, ： ( 1) △Methy level≥0.2；(2) q-value小于等于0.05；;DMR相关基因的GO、KEGG和InterPro富集分析;ChIP-seq研究方法及分析内容;峰基因功???分析;3. 关键分析内容;1. 样品制备及检测标准;Qubit;;边合成边测序 可逆阻断技术，激光荧光基团，捕获激发光;Raw data;Reads 比对情况统计;Raw data;