广东地区冬瓜感染的小西葫芦黄花叶病毒检测及其外壳蛋白基因多样性分析.pdfVIP

园艺学报，2016 ，43 (1) ：151 –160. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0558；http ：//www. ahs. ac. cn 151 广东地区冬瓜感染的小西葫芦黄花叶病毒检测 及其外壳蛋白基因多样性分析 1,* 1 1 2 3 1 1 赵 芹 ，谢大森 ，何晓明 ，李华平 ，尤 毅 ，罗少波 ，彭庆务 1 2 3 （广东省农业科学院蔬菜研究所，广州 510640 ； 华南农业大学农学院植物病毒研究室，广州 510642 ； 广东省农 业科学院环境园艺研究所，广州 510640 ） 摘 要：小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus ，ZYMV ）是危害广东省冬瓜的常见病毒。 摸索了冬瓜叶片总 RNA 最佳提取方法，通过基于 ZYMV 病毒外壳蛋白基因（coat protein gene ，cp ）序列 的 RT-PCR 扩增，检测采集自广东省 9 个冬瓜产区的 76 份病毒侵染样品的病毒田间发病率；将扩增产物 克隆测序，利用 MegAlign 软件构建系统发育进化树分析 cp 基因遗传变异与系统进化。结果表明，24 份 样品检测为阳性，田间发病率为 31.59% ；所有参试病毒分离物cp 基因全长 840 bp，编码 279 个氨基酸的 多肽；测序的 16 个分离物 cp 基因的核苷酸序列与推导蛋白的氨基酸序列相似性分别为 98.1% ~ 100%与 96.1% ~ 100% ；所有广东分离物的推导氨基酸序列基序保守，除GD121-9 增加 2 个人类白细胞抗原外， 其他均包含 5 个人类白细胞抗原及 1 个 N 糖基化位点，均包含保守 potyv_CP 功能域及与病毒蚜传相关的 结构域 DAG 三联盒“Asp-Ala-Gly ”；系统进化分析表明，ZYMV 病毒划分为 7 个基因型，广东分离物均 属于同一基因型Ⅰ，包含 3 个株系；广东地区的 16 个分离物分为 3 组，无明显地域选择性。总体上广东 ZYMV-cp 比较保守，分子变异较小。明确了广东省冬瓜上ZYMV 病毒的侵染情况及外壳蛋白基因的变异 特点，为对其致病性和抗病毒基因工程等研究提供依据。 关键词：冬瓜；小西葫芦黄花叶病毒；外壳蛋白基因；遗传变异 中图分类号：S 642.3 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2016 ）01-0151-10 Detection of Zucchini yellow mosaic virus Infecting Wax Gourd in Guangdong Province and Genetic Variation of Its Coat Protein Gene 1,* 1 1 2 3 1 ZHAO Qin ，XIE Da-sen ，HE Xiao-ming ，LI Hua-ping ，YOU Yi ，LUO Shao-bo ，and PENG 1 Qing-wu 1 2 （Vegetable Research Institute，Guangdong Academy of Agricultural Sciences，Guangzhou 510640，China；P