茎瘤芥（榨菜）根肿病不同发病时期根际土壤真菌群落变化特征的高通量分析.pdfVIP

2016（5）：33-37 中 国 蔬 菜 研究论文 CHINA VEGETABLES 茎瘤芥（榨菜）根肿病不同发病时期根际 土壤真菌群落变化特征的高通量分析 1 1 2 1 1 1* 王殿东 　谭永忠 　田雪亮 　张　超 　秦明一 　潘丽梅 （长江师范学院，重庆408100； 河南科技学院，河南新乡453003）1 2 摘　要 ：茎瘤芥（榨菜）根肿病是一种土传病害，与根际土壤真菌群落存在密切关系。本试验采用454高通量测序方法，以 土壤真菌的18SrDNA序列为靶标，研究茎瘤芥根肿病不同发病时期（移栽前、移栽后发病前、发病初期、发病中期、采收后） 土壤真菌群落的变化规律。结果表明：经454高通量测序，茎瘤芥根肿病各发病时期的OUT平均数量为1056个。依据OUT 所属真菌物种信息对土壤真菌群落结构进行分析，子囊菌亚门真菌在各个时期土壤中均为优势真菌类群，其次为担子菌亚门 真菌。移栽后发病前、发病初期和发病中期土壤真菌群落的Shannon和Simpson多样性指数、OTU数量和属的数