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应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因-浙江大学学报
第41卷 第3期 浙 江 大 学 学报 (医学 版 ) Vol41 No3
2012年 JOURNALOFZHEJIANGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCES) 2012
http: www.journals.zju.edu.cn/med DOI:10.3785/j.issn.10089292.2012.03.007
∥
应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因
易晓青,肖延风,尹春燕,徐尔迪
(西安交通大学第二附属医院儿科,陕西 西安710004)
[摘 要] 目的:利用脂肪分化细胞模型筛选与脂肪细胞分化相关的差异性表达基因。方法:采
用抑制性消减杂交技术,以诱导分化后的人前体脂肪细胞系SW872总RNA为Tester,诱导分化前
的人前体脂肪细胞系SW872为 Driver,将消减杂交获得的DNA片段与 pGMT载体连接,构建
cDNA文库后,转化大肠杆菌DH5,筛选阳性克隆。将获得的阳性克隆插入片段进行测序分析,并
α
与GenBank数据库进行同源性分析,获得差异性表达基因。结果:扩增消减cDNA文库获得135个
白色克隆,随机挑选64个进行测序,共获得34个阳性克隆基因。结论:本研究成功构建了脂肪细
胞分化差异性表达基因的消减cDNA文库,筛选出了与脂肪细胞分化相关的差异表达基因。
[关键词] 肥胖症;基因文库;杂交,遗传;DNA,互补/遗传学;克隆,分子;细胞,培养的;细胞
分化/遗传学;脂细胞/遗传学
[中图分类号] R781 [文献标志码] A [文章编号] 10089292(2012)03026707
Screening of differentially expressed genes during adipocyte
differentiationbysuppressionsubtractivehybridizationtechnique
YIXiaoqing,XIAOYanfeng,YINChunyan,XUErdi(DepartmentofPediatrics,SecondHospitalof
Xi′anJiaotongUniversity,Xi′an710004,China)
[Abstract] Objective:Toscreeningdifferentiallyexpressedgenesrelatedtoadipocytedifferentiation.
Methods:TotalRNAextractedfromthepreadipocytecelllineSW872wastakenastheDriverandthe
totalRNAfromthedifferentiatedadipocytesSW872astheTester.Suppressionsubtractivehybridization
(SSH)wasusedtoisolatethecDNAfragmentsofdifferentiallyexpressedgenes.TheproductsofSSH
wereinsertedintopGMTvectortoestablishthesubtractivelibrary.ThelibrarywasamplifiedthroughE.
colitransformationandpositiveclonesofthetransformantswerescreened.Positivecloneswere
sequenced.NucleicacidsimilaritywassubsequentlyanalyzedbycomparingwiththedatafromGenBank.
Results:Therewere135whiteclonesinthecDNAlibrary,64positivecloneswerechosenrandomlyand
sequencedandsimilaritysearchrevealed34 geneswhichexpresseddifferentiallyinadipocyte
differentiation.Conclusion:ThesubtractedcDNAlibraryford
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