应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因-浙江大学学报.pdfVIP

应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因-浙江大学学报.pdf

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应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因-浙江大学学报

第41卷 第3期 浙 江 大 学 学报 (医学 版 ) Vol41 No3   2012年 JOURNALOFZHEJIANGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCES)   2012 http: www.journals.zju.edu.cn/med DOI:10.3785/j.issn.10089292.2012.03.007 ∥ 应用抑制性消减杂交技术筛选脂肪细胞分化相关基因 易晓青,肖延风,尹春燕,徐尔迪 (西安交通大学第二附属医院儿科,陕西 西安710004) [摘 要] 目的:利用脂肪分化细胞模型筛选与脂肪细胞分化相关的差异性表达基因。方法:采 用抑制性消减杂交技术,以诱导分化后的人前体脂肪细胞系SW872总RNA为Tester,诱导分化前 的人前体脂肪细胞系SW872为 Driver,将消减杂交获得的DNA片段与 pGMT载体连接,构建 cDNA文库后,转化大肠杆菌DH5,筛选阳性克隆。将获得的阳性克隆插入片段进行测序分析,并 α 与GenBank数据库进行同源性分析,获得差异性表达基因。结果:扩增消减cDNA文库获得135个 白色克隆,随机挑选64个进行测序,共获得34个阳性克隆基因。结论:本研究成功构建了脂肪细 胞分化差异性表达基因的消减cDNA文库,筛选出了与脂肪细胞分化相关的差异表达基因。 [关键词] 肥胖症;基因文库;杂交,遗传;DNA,互补/遗传学;克隆,分子;细胞,培养的;细胞 分化/遗传学;脂细胞/遗传学 [中图分类号] R781  [文献标志码] A  [文章编号] 10089292(2012)03026707 Screening of differentially expressed genes during adipocyte differentiationbysuppressionsubtractivehybridizationtechnique YIXiaoqing,XIAOYanfeng,YINChunyan,XUErdi(DepartmentofPediatrics,SecondHospitalof Xi′anJiaotongUniversity,Xi′an710004,China) [Abstract] Objective:Toscreeningdifferentiallyexpressedgenesrelatedtoadipocytedifferentiation. Methods:TotalRNAextractedfromthepreadipocytecelllineSW872wastakenastheDriverandthe totalRNAfromthedifferentiatedadipocytesSW872astheTester.Suppressionsubtractivehybridization (SSH)wasusedtoisolatethecDNAfragmentsofdifferentiallyexpressedgenes.TheproductsofSSH wereinsertedintopGMTvectortoestablishthesubtractivelibrary.ThelibrarywasamplifiedthroughE. colitransformationandpositiveclonesofthetransformantswerescreened.Positivecloneswere sequenced.NucleicacidsimilaritywassubsequentlyanalyzedbycomparingwiththedatafromGenBank. Results:Therewere135whiteclonesinthecDNAlibrary,64positivecloneswerechosenrandomlyand sequencedandsimilaritysearchrevealed34 geneswhichexpresseddifferentiallyinadipocyte differentiation.Conclusion:ThesubtractedcDNAlibraryford

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