山东枣疯病植原体的鉴定及分子变异分析-植物病理学报-中国农业.pdfVIP

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2017-11-25 发布于天津
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山东枣疯病植原体的鉴定及分子变异分析-植物病理学报-中国农业.pdf

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山东枣疯病植原体的鉴定及分子变异分析-植物病理学报-中国农业

植物病理学报ＡＣＴＡＰＨＹＴＯＰＡＴＨＯＬＯＧＩＣＡＳＩＮＩＣＡ　４５(２):１１３￣１２０(２０１５) ｄｏｉ:１０.１３９２６/ｊ.ｃｎｋｉ.ａｐｐｓ.２０１５.０２.００１山东省枣疯病植原体的鉴定及分子变异分析１ꎬ２３１１１１∗ 陈妮 ꎬ刘永光 ꎬ仇平平 ꎬ刘文浩 ꎬ苏文敏 ꎬ竺晓平１２３ ( 山东农业大学植物保护学院植物病理系ꎬ泰安２７１０１８ꎻ 福山区农业局ꎬ福山２６５５００ꎻ 潍坊科技学院ꎬ潍坊２６２７００) 摘要:本研究对山东省１１个地区的枣疯病样品进行了鉴定和分子变异分析ꎮ 以样品总ＤＮＡ为模板ꎬ经扩增和序列测定ꎬ 分别得到１６ＳｒＲＮＡ (１４３２ｂｐ)、核糖体蛋白基因ｒｐ (１１９６ｂｐ)、转运蛋白基因ｓｅｃＡ (８３６ｂｐ) 和ｓｅｃＹ (１４２１ｂｐ) 的序列ꎬ ｓｅｃＡ基因序列是首次从枣疯病植原体中扩增获得ꎮ 对获得的序列与ＮＣＢＩ数据库中相关植原体序列进行聚类和核苷酸变异分析ꎬ结果显示山东省枣疯病植原体属于１６ＳｒⅤ￣Ｂ、ｒｐⅤ￣Ｃ、ｓｅｃＹⅤ￣Ｃ亚组ꎬ相对于１６ＳｒＲＮＡ基因ꎬｒｐꎬｓｅｃＡ和ｓｅｃＹ变异更大ꎬ非同义突变更多ꎬ更利于对国内不同来源的枣疯病植原体的精细系统进化分析ꎮ 关键词:枣疯病ꎻ植原体ꎻ分子鉴定ꎻ序列多态性Ｍｏｌｅｃｕｌａｒｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｏｆｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｊｕｊｕｂｅｗｉｔｃｈｅｓ’ ｂｒｏｏｍｉｎＳｈａｎｄｏｎｇＰｒｏｖｉｎｃｅ１ꎬ２３　ＣＨＥＮＮｉ ꎬＬＩＵＹｏｎｇ￣ｇｕａｎｇ ꎬＱＩＵ１１１１１Ｐｉｎｇ￣ｐｉｎｇ ꎬＬＩＵＷｅｎ￣ｈａｏ ꎬＳＵＷｅｎ￣ｍｉｎ ꎬＺＨＵＸｉａｏ￣ｐｉｎｇ　 ( ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＰｌａｎｔＰａｔｈｏｌｏｇｙꎬＣｏｌｌｅｇｅｏｆＰｌａｎｔ２ＰｒｏｔｅｃｔｉｏｎꎬＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｔａｉａｎ２７１０１８ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ＦｕｓｈａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＢｕｒｅａｕꎬ Ｆｕｓｈａｎ２６５５００ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３ＷｅｉｆａｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅ＆ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＷｅｉｆａｎｇ２６２７００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｊｕｊｕｂｅｗｉｔｃｈｅｓ’ｂｒｏｏｍｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａ (ＪＷＢ) ｃｏｌｌｅｃｔｅｄｆｒｏｍＳｈａｎｄｏｎｇＰｒｏｖｉｎｃｅｗａｓｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄａｎｄｔｈｅｓｅｑｕｅｎｃｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｏｆｓｏｍｅｔｙｐｉｃａｌｇｅｎｅｓｗａｓｔｈｅｎａｎａｌｙｚｅｄ. Ｆｏｕｒｄｉｆｆｅｒｅｎｔｔｙｐｅｓｏｆｕｎｉｖｅｒｓａｌｐｒｉｍｅｒｐａｉｒｓｏｆｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａｗｅｒｅｕｓｅｄｔｏａｍｐｌｉｆｙ１.４ｋｂｆｒａｇｍｅｎｔｏｆ１６ＳｒＲＮＡꎬ１.２ｋｂｆｒａｇｍｅｎｔｏｆｒｐｇｅｎｅꎬ０.８ｋｂｆｒａｇｍｅｎｔｏｆｓｅｃＡｇｅｎｅꎬ １.４ｋｂｆｒａｇｍｅｎｔｏｆｓｅｃＹｇｅｎｅꎬａｎｄｔｈｅｓｅｃＡｇｅｎｅｗａｓｆｉｒｓｔａｍｐｌｉｆｉｅｄｆｒｏｍｊｕｊｕｂｅｗｉｔｃｈｅｓ’ ｂｒｏｏｍｐｈｙｔｏｐｌａｍａ. ＴｈｅＰＣＲ￣ａｍｐｌｉｆｉｅｄｐｒｏｄｕｃｔｓｗｅｒｅｓｅｑｕｅｎｃｅｄａｎｄｃｏｍｐａｒｅｄｗｉｔｈｔｈｅｒｅｌａｔｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａｓｉｎＮＣＢＩ. Ｔｈｅｒｅ