梨β–微管蛋白基因及其在矮生型与普通型梨茎尖中的表达差异.pdfVIP

园艺学报，2016 ，43 (2) ：320 –328. Acta Horticulturae Sinica 320 doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0696；http ：//www. ahs. ac. cn 梨 β–微管蛋白基因及其在矮生型与普通型梨 茎尖中的表达差异 * 侯董亮，王彩虹 ，田义轲，肖玉雄，张 蓓 （青岛农业大学园艺学院，山东青岛 266109 ） 摘 要：以模式植物拟南芥的β–微管蛋白为参考依据，通过电子克隆的方法，从西洋梨基因组中克 隆了 9 个 β–微管蛋白基因，并根据苹果和梨基因组间的保守性及共线性原理，实现了这些基因的染色体 定位。序列分析显示，这组基因均含有 3 个外显子和两个内含子。起源于全基因组复制事件而形成的成 对染色体上的基因不仅在外显子和内含子长度上具有较高的保守性，而且编码的氨基酸残基也有更高的 序列相似性。对 9 个 β–微管蛋白基因在矮生梨与普通梨杂种群体中的荧光定量表达分析表明，有7 个基 因在茎尖组织中表达，其中定位于 chr16 上的转录本号为 PCP044487.1 的基因在矮生型和普通型梨茎尖中 的转录水平出现极显著差异，推测该基因可能与梨矮生性状形成的分子调控有重要关系。 关键词：梨；矮生性状；β–微管蛋白；基因结构；转录水平 中图分类号：S 661.2 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2016 ）02-0320-09 A Group of β-tubulin Genes and Their Expression Difference in Stem Tips Between the Dwarf and Standard Type Pears * HOU Dong-liang ，WANG Cai-hong ，TIAN Yi-ke，XIAO Yu-xiong ，and ZHANG Bei （College of Horticulture，Qingdao Agricultural University，Qingdao，Shandong 266109 ，China ） Abstract ：Using the β-tubulins of Arabidopsis as references，9 β-tubulin genes were identified from the Pyrus communis genome. These genes were mapped in the corresponding chromosomes based on the principle of conservation and collinearity between the genomes of apple and pear. Sequence analysis showed that each of these genes contain 3 exons and 2 introns. For the genes located in the pair of chromosomes which originated from the genome wide duplication in evolution，the lengths of exons and introns are more conserved ，and their coding sequences of amino-acid residues are with higher similarity. The result of qRT-PCR sh