影响猪生长和肉质性状的显著SNP在大约克和长白群体内的多态性分析-论文.pdfVIP

山东 农 业科 学 2016，48(8)：128～133 ShandongAgriculturalSciences DOI：10．14083／j．issn．1001—4942．2016．08．029 影响猪生长和肉质性状的显著 SNP在大约克 和长 白群体内的多态性分析 王彦平 ，王怀中 ，姜运 良，郭建凤 ，王继英 (1．山东省农业科学院畜牧兽医研究所／山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室，山东 济南 250100； 2．山东农业大学动物科技学院，山东 泰安 271018) 摘 要：通过文献搜索，收集整理了影响猪生长和肉质性状的显著单核苷酸多态性(singlenucleotidepoly— morphism，SNP)位点，基于飞行时间质谱技术对大约克 (n=400)和长白(n=399)样本进行 SNP快速分型，并 分析了这些位点在大约克和长白群体内的基因型、等位基因频率、哈代一温伯格平衡状态等遗传学特征。结 果表明：利用飞行时间质谱技术可对 17个影响猪肉质和生长性状的显著SNP位点进行同时快速基因分型， 平均个体检出率为96．35％；17个被检SNP位点中9个为多态位点，其它8个为只有一种基因型的单态位点； 多态SNP位点中有6个处于哈代一温伯格平衡状态，其它3个严重偏离哈代 一温伯格平衡。本研究收集了 对猪生长和肉质性状具有显著效应的SNP位点 ，探讨了利用飞行质谱技术进行多位点 SNP快速分型的可行 性 ，为今后建立猪生长和肉质性状标记辅助选择 、加快猪的遗传研究进展奠定基础。 关键词：猪；飞行时间质谱技术；单核苷酸多态性(SNP)；等位基因频率；标记辅助选择 中图分类号：$828．2 文献标识号：A 文章编号 ：1001—4942(2016)08—0128—06 Polymorphism AnalysisofSignificantSNP RelatedwithGrowthand MeatQualityinYorkshireandLandracePigPopulations WangYanping，WangHuaizhong ，JiangYunliang，GuoJianfeng，WangJiying (1．InstituteofAnimalScienceandVeterinaryMedicine，ShandongAcademyofAgriculturalSciences／ ShandongKeyLaboratoryofAnimalDiseaseControlandBreeding，finan250100，China； 2．CollegeofAnimalScienceandTechnology，ShandongAgriculturalUniversity，Taian271018，China) Abstract Inthestudy．wecollectedthesinglenucleotidepolymorphism (SNP)locirelatedwithgrowth andmeatqualityofpigsbysearchingpublishedpapersandpublicdatabases．Basedon thetime—of—flight massspectrometry(TOF—MS)technique，wegenotypedthesamplesofYorkshire(n=400)andLandrace (n=399)，andanalyzedthegenotyperfequency，allelerfequency，andHardy—WeinbergEquilibriumtesting oftheseSNPs．TheresultsshowedthatusingTOF—MS，wesuccessfullygenotyped17SNPsatthesametime， andtheaveragecallrateoftheseSNPswas96．35％ ．Nineofthe17SNPswerepolymorphicloci，andthe other8weremonomorphicloci，whichhadonlyonegenoty